红灯时在右转车道停车等待不会扣分，但若未按规定右转或存在其他违法行为则可能被处罚。具体分析如下：

1. 红灯时在右转车道停车等待本身不违法
   根据《道路交通安全法实施条例》第三十八条，红灯亮时，右转弯车辆在不妨碍被放行车辆、行人通行的情况下可以通行。但“可以通行”不等于“必须通行”，若前方道路拥堵、行人正在通过人行横道或存在其他安全隐患，驾驶员有权选择停车等待，此行为不构成违法，不会被扣分或罚款。

2. 若因未按规定右转被处罚，需结合具体违法行为判断
   您提到“红灯右转被扣6分罚200”，可能是以下情形导致：

   • 未礼让行人：若右转时未停车让行正在通过人行横道的行人，根据《道路交通安全法》第四十七条，可处20-200元罚款，部分地区可能同时扣3分（但扣6分通常需结合其他严重违法行为，如肇事逃逸等）。
     
   • 违反信号灯指示：若右转车道信号灯为箭头红灯（而非圆形红灯），此时右转属于“闯红灯”，根据《道路交通安全法》第九十条，可处200元罚款、扣6分。
     
   • 不按规定车道行驶：若在直行车道右转，可能被认定为“违反禁止标线指示”，扣3分并罚款200元（但此情形与“红灯右转”直接关联性较弱，需结合现场情况判断）。

3. 关键建议：核实处罚依据并针对性处理

   • 查看处罚决定书：处罚决定书会明确记载违法行为代码（如“1625”代表闯红灯），可通过代码查询具体违法情形。
     
   • 申请行政复议：若认为处罚有误（如信号灯故障、被误拍等），可在收到处罚决定书后60日内向交警部门申请复议，或通过“交管12123”APP在线申请。
     
   • 日常驾驶注意：右转前需观察信号灯类型（圆形灯可右转，箭头灯需按指示通行）、礼让行人，并确保不占用非机动车道或人行横道。

总结：红灯时在右转车道停车等待本身不扣分，但若因未礼让行人、闯箭头红灯等违法行为被处罚，需根据具体情形承担责任。建议结合处罚决定书内容进一步核实，如有疑问可随时向我咨询。