结论：中介帮你做假营业执照并收取三千元的行为是违法的，且可能涉及多重法律责任。
法律分析：
行政责任：
- 根据《中华人民共和国公司登记管理条例》等相关法律法规，伪造、变造、出租、出借、转让营业执照是违法行为。中介作为提供此类非法服务的主体，一旦被发现，将面临工商行政管理部门的严厉处罚，包括但不限于罚款、没收违法所得、吊销营业执照等。
- 对于你作为接受服务的一方，如果明知是假营业执照而使用，同样可能面临行政处罚，如罚款、警告等。
刑事责任：
- 如果中介的行为构成伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，中介可能面临三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，还可能面临更重的刑罚。
- 你作为接受并可能使用假营业执照的一方，如果明知是犯罪所得而予以接受或使用，也可能构成相关犯罪的共犯或从犯，面临刑事处罚。
民事责任：
- 如果因使用假营业执照导致他人遭受损失，如消费者因信任假营业执照而遭受经济损失，你作为使用假营业执照的一方可能需要承担民事赔偿责任。
- 中介作为提供非法服务的一方，如果因其行为导致你或其他第三方遭受损失，同样可能需要承担民事赔偿责任。
建议：
- 立即停止使用：如果你已经获得了假营业执照，应立即停止使用，并尽快向工商行政管理部门报告情况，配合调查处理。
- 寻求合法途径：如果你需要办理营业执照，应通过合法途径向工商行政管理部门申请，遵守相关法律法规和程序要求。
- 保留证据：如果你与中介之间有交易记录、聊天记录等证据，应妥善保留，以便在需要时向相关部门提供线索或证明自己的清白。
- 咨询专业律师：如果你对相关法律问题存在疑问或担忧，可以直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
后续行动：
- 如果你发现中介仍在从事此类非法活动，可以向工商行政管理部门或公安机关举报，以维护市场秩序和公共利益。
- 如果你因使用假营业执照而面临法律纠纷或处罚，应及时寻求法律援助，以维护自己的合法权益。