结论：如果不是公司法人且投资款未备注，处理方式会因具体情况而异，但通常可以通过收集其他证据来证明投资事实，并考虑通过协商、诉讼等途径来维护自身权益。以下是对这一问题的详细分析：
一、投资事实的证明
收集其他证据：
- 尽管投资款未备注，但您仍可以尝试收集其他能够证明投资事实的证据，如转账记录、银行流水、与公司的沟通记录（如邮件、短信、微信等）、公司出具的收据或确认函等。
- 如果您是通过第三方（如其他股东或中介）进行的投资，还可以考虑收集第三方的证言或书面证明。
证人证言：
- 如果有其他股东或公司员工知晓您的投资情况，他们的证言也可以作为证明投资事实的依据。
二、法律关系的认定
股东身份确认：
- 如果您能够证明投资事实，且公司章程或股东名册中有您的名字（或通过其他方式能够确认您的股东身份），则您有权享有股东权益。
- 如果公司拒绝确认您的股东身份，您可以通过法律途径（如诉讼）来要求确认。
投资协议审查：
- 审查您与公司或与其他股东之间是否签订了投资协议。投资协议是证明投资关系的重要法律文件，其中应明确投资金额、投资方式、股权比例等关键条款。
- 如果投资协议存在且内容明确，则您可以直接依据协议来维护自身权益。
三、维权途径
协商：
- 在证据充分的情况下，您可以首先尝试与公司进行协商，要求公司确认您的股东身份并享有相应的股东权益。
诉讼：
- 如果协商无果，您可以考虑通过诉讼途径来维护自身权益。在诉讼过程中，您需要提交上述收集到的证据来证明投资事实和股东身份。
- 诉讼可能涉及确认股东资格之诉、要求分配红利之诉等，具体取决于您的诉求和实际情况。
其他途径：
- 根据具体情况，您还可以考虑通过仲裁、调解等其他途径来解决争议。
四、风险提示
证据收集难度：
- 由于投资款未备注，证据收集可能存在一定的难度。因此，您需要尽可能全面地收集其他相关证据来支持您的主张。
诉讼风险：
- 诉讼过程中存在不确定性，包括诉讼结果、诉讼时间、诉讼成本等。因此，在决定诉讼前，您需要充分评估诉讼风险并做好相应的准备。
建议：鉴于您目前的情况，我建议您首先尝试收集其他能够证明投资事实的证据，并与公司进行协商。如果协商无果，您可以考虑咨询专业律师（即我本人，江海龙律师，专注于婚姻家庭、债权债务领域，但在此类公司法务问题上也有丰富经验）来评估诉讼风险并制定相应的维权策略。如果您有任何进一步的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。