在刑事案件中，被告人被公安机关羁押，一般不可以直接进行缺席审判。以下是对此问题的详细分析：
一、缺席审判的法定情形
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，缺席审判主要适用于以下特定情形：
贪污贿赂犯罪案件，以及需要及时进行审判，经最高人民检察院核准的严重危害国家安全犯罪、恐怖活动犯罪案件：在这些案件中，如果犯罪嫌疑人、被告人在境外，且满足一定条件，如逃匿境外、通知送达后逾期未归等，法院可以依法进行缺席审判。
被告人因严重疾病无法出庭，中止审理超过六个月仍无法出庭，被告人及其法定代理人、近亲属申请或者同意恢复审理的：在此情况下，法院也可以进行缺席审判，但需确保被告人的诉讼权利得到充分保障。
被告人死亡，但有证据证明被告人无罪，经缺席审理确认无罪的：这种情况下，法院可以依法判决被告人无罪。
从上述规定可以看出，被告人被公安机关羁押并不属于缺席审判的法定情形。羁押只是暂时限制了被告人的人身自由，并未剥夺其参与诉讼的权利。
二、被告人被羁押时的处理方式
在刑事案件中，如果被告人被公安机关羁押，法院通常会采取以下措施来保障其诉讼权利：
调整开庭时间：法院会根据被告人的羁押情况，灵活调整开庭时间，以确保被告人能够出庭参与诉讼。
在羁押场所开庭审理：在必要时，法院可能会决定到被告人被羁押的场所（如看守所）开庭审理案件，以便被告人能够亲自参与庭审过程。
保障被告人的辩护权：无论被告人是否被羁押，法院都会确保其享有充分的辩护权，包括委托辩护人、申请法律援助等。
三、缺席审判的严格限制
缺席审判在刑事案件中是一种特殊的审判方式，其适用受到严格的限制。这是因为缺席审判可能剥夺被告人的部分诉讼权利，如当庭陈述、质证等，从而影响审判的公正性。因此，法院在决定是否进行缺席审判时，会非常谨慎地审查相关条件，确保被告人的诉讼权利得到充分保障。
四、建议与总结
对于被告人被公安机关羁押的情况，建议被告人及其家属积极与法院沟通，了解案件进展和开庭安排。同时，被告人也有权委托辩护人或申请法律援助，以维护自己的合法权益。
总结来说，在刑事案件中，被告人被公安机关羁押并不构成缺席审判的法定情形。法院会采取多种措施来保障被告人的诉讼权利，确保审判的公正性和合法性。如果被告人或其家属对案件处理有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。