结论前置：公司能否因员工患有重度抑郁而开除，需根据员工所处的医疗期、工作能力及行为表现等具体情况，并严格遵守相关法律法规来判断。在医疗期内，公司通常不得开除；医疗期满后，若员工无法从事原工作或新安排的工作，公司可依法开除但需支付经济补偿。
一、医疗期内的保护
法律依据：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者因患病（包括重度抑郁）或非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得依照无过失性辞退或经济性裁员的规定解除劳动合同。医疗期的长度根据劳动者的实际工作年限和在本单位的工作年限确定，从3个月到24个月不等。
实例说明：
- 假设员工小张在公司工作了5年，患上重度抑郁后，他应享有至少6个月的医疗期。在此期间，公司不能以他患病为由开除他，否则将构成违法解除劳动合同，需承担相应的法律责任。
二、医疗期满后的情况
可以开除的条件：
- 若员工在医疗期满后，不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，根据《劳动合同法》第四十条，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。但此时，用人单位应当向劳动者支付经济补偿，具体标准依据《劳动合同法》第四十六条和第四十七条执行。
- 经济补偿的计算公式为：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
实例说明：
- 员工小李医疗期满后，仍无法胜任原工作或新安排的工作，公司在履行法定程序后，可以开除小李，但需支付相应的经济补偿。而若员工小王虽患重度抑郁，但医疗期满后能够正常从事原工作，则公司不得以其曾患病为由开除。
三、特殊情形的处理
- 即便在医疗期内或医疗期满后，若员工存在严重违反用人单位规章制度、严重失职、营私舞弊等过错行为（即符合《劳动合同法》第三十九条的情形），公司也可以依法解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
四、法律建议
加强员工心理健康管理：
- 公司应重视员工的心理健康，提供必要的心理支持和辅导，以降低因心理健康问题导致的劳动纠纷风险，同时也有助于提升员工的工作效率和忠诚度。
依法处理开除事宜：
- 在处理涉及重度抑郁员工的开除事宜时，公司必须严格遵守法律法规，确保程序的合法性和正当性，避免引发不必要的法律纠纷。建议公司在处理此类问题时，积极与员工沟通，尝试调整岗位或提供其他合理安排，以体现人文关怀和法律精神。
及时咨询专业律师：
- 由于劳动法律问题具有复杂性和专业性，公司在处理涉及重度抑郁员工的开除事宜时，建议及时咨询专业律师，以确保处理方式的合法性和合规性。
总之，公司能否因员工患有重度抑郁而开除，需综合考虑员工的医疗期、工作能力、行为表现以及相关法律法规的规定。在任何情况下，公司都应秉持人文关怀和法律精神，妥善处理相关事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。