针对您提出的“斑马线有车有行闯红灯，机动车恶意撞人怎么处理”的问题，这是一个涉及交通法规、责任判定以及法律后果的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、责任判定
行人闯红灯的责任：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》，行人通过路口或横过道路时，应走人行横道或过街设施，并遵守交通信号灯指示。行人闯红灯显然违反了这一规则，存在明显过错。
- 若机动车一方正常行驶，无超速、酒驾、闯红灯等违法行为，且已采取必要制动措施仍无法避免事故，行人闯红灯的过错对事故发生起决定性作用，行人可能需要承担主要甚至全部责任。
机动车的责任：
- 机动车行经人行横道时应减速行驶，遇行人正在通过时需停车让行。这是机动车驾驶员的基本义务。
- 若机动车存在超速、观察不力、未及时制动或恶意撞人等违法行为，这些行为对事故发生起到了推动作用，机动车驾驶员将承担相应责任。特别是“恶意撞人”这一行为，若经查实，将构成严重的交通违法，甚至可能涉及刑事犯罪。
特殊情况：
- 如果机动车驾驶员的行为构成交通肇事罪，如酒驾、毒驾、无驾驶资格驾驶等导致重大事故，或者恶意撞人，将面临更为严厉的刑事处罚。
- 若事故中存在违停车辆等其他因素，也可能影响责任判定，需根据具体情况综合考量。
二、法律后果与处罚
民事责任：
- 责任方需承担因事故造成的全部或部分损失，包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、丧葬费等。赔偿项目和金额需根据实际情况确定，协商不成可提起民事诉讼。
- 在行人闯红灯且机动车无过错的情况下，机动车一方承担的赔偿责任不超过百分之十。但若机动车存在过错或恶意撞人，则需承担更高比例的赔偿责任。
行政责任：
- 机动车驾驶员可能面临扣分、罚款等行政处罚，如扣减车辆驾驶分数、行政警告或罚款等。对于恶意撞人等严重违法行为，行政处罚将更为严厉。
刑事责任：
- 若机动车驾驶员的行为构成交通肇事罪或故意伤害罪等刑事犯罪，将面临三年以下有期徒刑或拘役的处罚。逃逸或有其他特别恶劣情节的，刑罚将更为严厉。
三、处理建议
立即报警：
- 发生事故后，应立即报警并保护现场，等待交通管理部门的到来。
配合调查：
- 双方应积极配合交通管理部门的调查处理，提供真实、准确的证言和证据。
寻求法律援助：
- 如对责任判定或赔偿问题有异议，可寻求法律援助或咨询专业律师，以便妥善处理事故责任和赔偿问题。
遵守交通规则：
- 无论是机动车驾驶员还是行人，都应严格遵守交通规则，尊重他人的生命权和健康权，共同维护良好的交通秩序。
综上所述，斑马线有车有行闯红灯且机动车恶意撞人的情况涉及复杂的责任判定和法律后果。在处理此类事故时，应依据相关法律法规和实际情况进行综合考量，并依法承担相应的法律责任。同时，也提醒广大交通参与者，安全永远是第一位的，切勿因一时疏忽而酿成不可挽回的后果。