在查处在建违法建设过程中，保障当事人陈述申辩权利的核心在于严格遵循法定程序，确保当事人知情权、参与权和救济权的有效实现。具体可从以下角度保障：

1. 事前告知程序必须完整
   行政机关在作出《责令停止建设决定书》或《限期拆除决定书》前，需以书面形式明确告知当事人：

   • 拟认定违法建设的具体事实（如建设时间、位置、面积等）
     
   • 认定违法的法律依据（如《城乡规划法》第64条）
     
   • 拟作出的行政处罚内容及依据
     
   • 陈述申辩的期限（通常不少于3个工作日）及方式（书面或口头）
     
   • 不陈述申辩的法律后果
     案例参考：某市城管局因未在决定书中载明申辩期限，被法院判决程序违法。

2. 申辩渠道需畅通无阻

   • 书面申辩：应提供标准格式的《陈述申辩书》模板，明确接收部门及联系方式
     
   • 口头申辩：需制作《询问笔录》，由两名以上执法人员记录并签字，当事人有权核对修改
     
   • 电子申辩：允许通过政务平台、电子邮件等电子方式提交材料，但需确保可追溯性
     特别提示：对文化程度较低的当事人，执法人员应主动协助其完成申辩材料准备。

3. 实质性审查申辩内容
   行政机关需对当事人提出的以下申辩理由进行重点核查：

   • 是否存在规划许可或补办手续的可能
     
   • 建设行为是否属于”尚可采取改正措施消除对规划实施影响”的情形
     
   • 是否存在因政府原因导致无法办理许可的特殊情况
     法律后果：未对合理申辩进行复核直接作出处罚的，可能构成”程序重大违法”。

4. 救济途径的同步告知
   在最终处罚决定书中，必须明确告知当事人：

   • 60日内申请行政复议的机关及期限
     
   • 6个月内提起行政诉讼的法院及期限
     
   • 申请听证的权利（对拟作出较大数额罚款等处罚时）
     实践要点：建议同时提供《行政复议申请书》《行政起诉状》参考模板。

5. 特殊情形下的程序保障

   • 紧急拆除情形：对存在重大安全隐患需立即拆除的，应在拆除后24小时内补办告知程序
     
   • 当事人拒不配合：可邀请基层组织代表见证，全程录音录像，并注明拒签情况
     
   • 利害关系人申辩：相邻权人等第三人提出异议的，应纳入陈述申辩审查范围
     

温馨提示：若您收到《责令停止建设通知书》，建议从以下方面准备申辩材料：

1. 收集建设行为合法性的证据（如规划部门咨询记录）
   
2. 制作建设时间线说明（重点证明未超出行政处罚追溯时效）
   
3. 准备周边类似案例的裁判文书作为参考
   
4. 如有特殊困难，可申请延期陈述申辩
   

如需进一步分析具体案情，可直接向我提供相关文书材料，我将为您详细解读程序要点及申辩策略。