结论：您是否会受牵连，取决于您是否知情以及是否采取了合理措施防止此类行为的发生。以下从不同情况进行分析：
如果您完全不知情：
- 法律背景：在不知情的情况下，您的诊所并未主动参与或协助医药公司进行非法供货行为。根据一般法律原则，不知情且未参与的行为主体通常不承担法律责任。
- 可能后果：若您能提供充分证据证明您对医药公司的行为完全不知情，且未从中获得任何利益，那么您很可能不会被追究法律责任。但您可能需要配合相关部门的调查，以证明您的清白。
如果您知情但未采取措施：
- 法律背景：如果您知道医药公司打着您诊所的名义进行非法供货，但未采取任何措施制止或报告相关部门，那么您可能构成对非法行为的默许或纵容。
- 可能后果：在这种情况下，您可能会因未履行报告义务或协助非法行为而承担一定的法律责任，尽管这种责任可能相对较轻。具体责任取决于相关法律法规的规定以及案件的具体情况。
如果您知情并采取了措施：
- 法律背景：如果您发现医药公司打着您诊所的名义进行非法供货后，立即采取了措施制止，并向相关部门报告，那么您不仅不会承担法律责任，还可能因积极履行公民义务而受到表彰。
- 建议行动：立即与医药公司沟通，要求其停止非法行为；向当地药品监管部门或公安机关报告此事；保留所有相关证据，如沟通记录、供货单据等，以备不时之需。
法律建议：
- 加强内部管理：确保您的诊所内部有严格的供货管理制度，防止类似事件再次发生。
- 定期审查合作方：对与您诊所合作的医药公司进行定期审查，确保其合法合规经营。
- 及时咨询法律专业人士：如遇到类似情况，及时咨询法律专业人士，了解您的权利和义务，以及如何采取最佳措施保护自己。
可能涉及的法律条款：
- 虽然具体法律条款可能因地区而异，但一般涉及药品管理、商业欺诈、不正当竞争等方面的法律法规都可能与此类情况相关。例如，《中华人民共和国药品管理法》对药品的供货、销售等环节有严格规定，违反这些规定可能面临法律责任。
后续行动建议：
- 立即与医药公司沟通，要求其停止非法行为，并保留沟通记录作为证据。
- 向当地药品监管部门或公安机关报告此事，配合调查并提供所需证据。
- 如有必要，咨询法律专业人士，了解您的具体法律责任和应对策略。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。