关于公司内部股东无偿转让股权并已签协议后，法院强制变更工商登记的执行费用问题，结论如下：

1. 执行费用的承担主体
   根据《诉讼费用交纳办法》第38条，执行申请费由被执行人（即拒绝配合办理工商变更登记的一方）承担。若被执行人拒不履行，法院可直接从其财产中划扣。若因股权转让协议本身存在争议（如无效、可撤销等），导致执行程序启动，则可能根据过错比例分担费用，但此情形需以法院生效判决为准。

2. 执行费用的具体构成
   法院强制变更工商登记的执行费用通常包括：

   • 申请费：按执行标的金额计算（如股权价值对应的财产数额），无财产可供执行的案件可能按件收费（通常50-500元）；
     
   • 实际支出费用：如评估费、公告费、差旅费等（若有）。
     若工商变更仅涉及股东信息变更（不涉及股权价值评估），费用可能较低；若需评估股权价值，费用会相应增加。

3. 操作流程与注意事项

   • 申请强制执行：股东需持生效法律文书（如股权转让协议、法院判决书）向法院申请强制执行，并提交工商变更登记所需材料（如公司章程修正案、股东会决议等）；
     
   • 法院审查与执行：法院审查材料后，会向市场监管部门发出协助执行通知书，要求其办理变更登记。若被执行人或公司拒不配合，法院可对其采取罚款、拘留等措施；
     
   • 费用缴纳：执行费用通常由被执行人承担，但申请执行人可能需预缴部分费用（如评估费），最终按实际执行结果结算。

建议：若股东已签署无偿转让协议且协议合法有效，可先向公司发出书面通知要求配合变更登记。若公司或相关股东拒不配合，再向法院申请强制执行，并保留好协议、通知记录等证据。如有其他争议（如股权转让协议效力、其他股东优先购买权等），需先通过诉讼确认协议效力，再申请执行。

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