农村建设高标准农田的耕地费用负担问题，需根据具体情况判断，一般由政府、村集体或农民共同承担，具体如下：

1. 政府主导并承担主要费用
   根据《中华人民共和国土地管理法》《农田建设项目管理办法》等规定，高标准农田建设属于国家农业基础设施投资范畴，中央和地方财政通常承担主要费用，包括土地平整、灌溉排水、田间道路等工程费用。例如，农业农村部、财政部联合印发的《农田建设补助资金管理办法》明确，补助资金用于高标准农田建设，资金来源为中央和地方财政预算安排。

2. 村集体或农民承担部分费用（特殊情况）

   • 自愿参与或协商分担：若建设涉及农民自有土地的改良（如田块合并、沟渠修整），且农民自愿参与，可能通过“一事一议”方式协商分担部分费用（如青苗补偿、土地调整补偿等），但法律禁止强制摊派。
     
   • 地方政策差异：部分地区可能出台补充政策，要求村集体或农民承担少量费用（如维护基金），但需以地方性法规或政策文件为依据，且不得超出农民承受能力。

3. 社会资本参与（PPP模式）
   若通过政府和社会资本合作（PPP）模式建设高标准农田，社会资本方可能承担部分费用，但需通过公开招标、协议约定等方式明确权责，且农民无需直接承担费用。

建议：

• 若您所在地区涉及费用分担问题，可要求当地农业农村部门出示财政预算文件、政策依据或补偿方案，确保费用合法合规。
  
• 若遇到强制收费或费用不合理情况，可向县级以上农业农村局或财政局投诉，或通过行政复议、诉讼途径维护权益。
  

如有具体案例或地方政策疑问，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。