针对您提出的“宅基地是基本农田怎样确权”的问题，这确实是一个涉及土地性质与确权流程的特殊情况。首先，需要明确的是，宅基地与基本农田在土地性质上是不同的，宅基地主要用于农民居住，而基本农田则是用于农业生产的耕地，受到严格的保护。如果宅基地实际上被划定为基本农田，那么在确权过程中就需要特别注意以下几点：
一、了解土地性质与政策
核实土地性质：
- 您需要首先确认该宅基地是否确实被划定为基本农田。这可以通过查询当地的土地利用总体规划、土地调查成果或咨询当地土地管理部门来获取准确信息。
了解相关政策：
- 不同地区对于宅基地和基本农田的管理政策可能存在差异。您需要了解当地关于宅基地确权、基本农田保护以及两者之间冲突解决的具体政策。
二、确权流程的特殊处理
申请与审核：
- 如果宅基地确实被划定为基本农田，但您仍希望进行确权，您需要向所在村集体（村委会）提交宅基地使用权登记申请，并特别说明土地性质的情况。
- 村集体和乡镇人民政府在审核时，会特别注意该宅基地是否符合确权条件，特别是是否违反了基本农田保护的相关规定。
实地测量与调查：
- 相关部门会组织专业人员进行实地测量，并详细记录宅基地的位置、面积等信息。
- 在调查过程中，会特别关注该宅基地是否对基本农田造成了破坏或影响，以及是否有可能通过调整规划或补偿等方式解决冲突。
公告公示与审批：
- 审核通过的宅基地信息将在村内进行公告公示，以便村民提出异议或监督。
- 如果公示期间没有异议，且该宅基地的确权不违反基本农田保护的相关规定，乡镇人民政府将上报材料至县级人民政府进行最终审批。
三、特殊情况的处理建议
协商调整：
- 如果宅基地确实占用了基本农田，且无法通过确权程序合法化，您可以考虑与村集体或相关部门协商，看是否可以调整宅基地的位置或面积，以避免占用基本农田。
法律途径：
- 如果协商无果，且您认为自己的权益受到了侵害，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这可能包括咨询律师、提起行政诉讼等。
四、注意事项
权属清晰无争议：
- 无论宅基地是否占用基本农田，确权的前提都是权属清晰无争议。如果存在权属纠纷，需要先通过协商、调解或诉讼等方式解决争议后再进行确权。
依法依规进行：
- 整个确权过程应严格遵循法律法规和当地政策，确保确权工作的公正、准确和合法。任何违规行为都可能影响确权的效力。
综上所述，如果宅基地被划定为基本农田，确权过程将更为复杂和敏感。您需要充分了解当地政策、准备必要材料，并积极配合相关部门的调查和审核工作。同时，也要做好协商调整或法律途径的准备，以应对可能出现的特殊情况。