结论：在合伙人共同诉讼取得工程款后，若部分合伙人不同意强制执行，处理方式需依据合伙协议的约定、合伙人之间的协商以及相关法律规定来综合确定。以下是从不同角度给出的详细分析和建议。
一、合伙协议的约定
审查合伙协议：首先，应仔细审查合伙协议中关于工程款分配、执行程序以及合伙人之间争议解决方式的条款。如果合伙协议中有明确规定，在部分合伙人不同意强制执行的情况下，应按照协议约定处理。
协议效力：若合伙协议中规定了强制执行的相关程序或条件，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么这些规定对全体合伙人具有约束力。部分合伙人不同意强制执行，可能构成违约，需承担相应的法律责任。
二、合伙人之间的协商
沟通协商：在合伙协议没有明确规定或规定不明确的情况下，合伙人之间应首先尝试通过沟通协商来解决问题。可以召开合伙人会议，就工程款的分配和执行问题进行讨论，寻求共识。
达成一致：如果通过协商能够达成一致意见，那么可以按照协商结果来处理工程款的分配和执行问题。这有助于维护合伙人之间的和谐关系，避免不必要的法律纠纷。
三、法律途径
提起诉讼：如果协商无果，且部分合伙人坚持不同意强制执行，其他合伙人可以考虑通过法律途径来解决争议。可以依据《中华人民共和国民法典》中关于合伙合同的规定，向法院提起诉讼，请求法院判决按照合伙协议或法律规定分配工程款，并强制执行。
申请执行：在获得法院判决后，如果部分合伙人仍然拒绝履行判决义务，其他合伙人可以向法院申请强制执行。法院将依法对被执行人的财产进行查封、扣押、拍卖等措施，以实现判决所确定的债权。
四、注意事项
保留证据：在整个过程中，合伙人应保留好与工程款分配、执行相关的所有证据，包括合伙协议、会议记录、往来函件等。这些证据将在协商或诉讼过程中发挥重要作用。
遵守法律程序：在处理争议时，合伙人应严格遵守法律程序，不得采取非法手段来解决问题。否则，可能会面临法律制裁，并损害自身的合法权益。
寻求专业帮助：由于合伙纠纷涉及复杂的法律关系和法律规定，合伙人可以寻求专业律师的帮助来处理争议。律师将提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助合伙人更好地维护自身权益。
建议：在处理此类问题时，合伙人应保持冷静和理性，通过沟通协商来寻求解决方案。如果协商无果，再考虑通过法律途径来解决争议。同时，合伙人应增强法律意识，遵守法律程序，以维护自身的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。