结论：农商银行贷款按期还了，合同是否还有效需分情况讨论，一般情况下合同在履行完毕后仍然有效，但合同效力可能因具体条款或特殊情况而有所不同。
分析说明：
合同履行完毕后的基本效力：
- 根据一般的合同法律原则，合同在双方履行完毕各自义务后，并不会自动失效，而是继续保持其法律效力，只是双方的权利义务已经履行完毕，合同进入终止状态，但合同文本本身仍然存在，并可以作为双方曾经达成协议的证据。
- 在农商银行贷款的情境中，借款人按期偿还了贷款本金和利息，即履行了合同中的还款义务，银行也接受了还款，此时贷款合同的主要义务已经履行完毕。然而，这并不意味着合同完全失效，合同中的其他条款，如保密条款、争议解决条款等，可能仍然有效。
合同中的特殊条款影响：
- 如果贷款合同中明确约定了合同在还款完毕后即失效，或者约定了其他特定的失效条件，那么应当遵循合同中的这些特殊约定。
- 例如，有些贷款合同可能包含“本合同自借款人还清全部贷款本息之日起失效”的条款，在这种情况下，合同确实会在还款完毕后失效。
合同失效后的法律后果：
- 如果合同失效，那么双方基于该合同所享有的权利和承担的义务将终止。但是，这并不影响双方在合同失效前已经产生的权利和义务，也不影响合同中关于争议解决、保密等条款的继续有效。
- 此外，即使合同失效，如果一方在合同履行过程中存在违约行为，另一方仍然有权依据合同中的违约责任条款或相关法律规定追究其违约责任。
建议与行动：
- 审查合同条款：建议您仔细审查贷款合同中的条款，特别是关于合同效力、终止和违约责任等方面的规定，以明确合同在还款完毕后的具体状态。
- 保留合同文本：即使合同已经履行完毕，也建议您保留好合同文本，以备不时之需。合同文本可以作为您曾经与银行达成协议的证据，也可以在未来可能出现的争议中发挥重要作用。
- 咨询专业意见：如果您对合同效力或相关法律问题存在疑问，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况和合同条款，为您提供专业的法律意见和建议。