医生在自家药店卖药是否违法需分情况讨论，具体处理方式如下：

1. 若医生具备合法资质且符合规定，则不违法
   根据《药品管理法》及《执业医师法》，医生若同时持有《药品经营许可证》《医师执业证书》，且药店的药品来源合法、储存条件达标、销售行为符合诊疗规范（例如仅销售与自身诊疗范围相关的处方药，并严格审核处方），则属于合法经营。
   处理建议：确保所有证照齐全，定期接受药监部门检查，保留药品进货凭证、处方记录等材料，避免超范围经营或违规销售。

2. 若医生无合法资质或存在违规行为，则可能违法

   • 无证经营：若药店未取得《药品经营许可证》，或医生未注册为执业药师却直接参与药品销售，涉嫌违反《药品管理法》第115条（无证经营药品），可能面临没收违法所得、罚款（货值金额15-30倍），情节严重者可能被追究刑事责任。
     
   • 违规销售处方药：若未凭处方销售处方药，或未对处方进行审核，违反《药品流通监督管理办法》第18条，可能被警告、罚款（1万-3万元）。
     
   • 药品质量问题：若销售假药、劣药，或未按规定储存药品导致变质，可能触犯《刑法》第141条（生产销售假药罪）、第142条（生产销售劣药罪），最高可判无期徒刑。
     

处理建议：立即停止违规行为，配合药监部门调查，主动整改（如补办证照、完善处方审核制度）；若已受到行政处罚，需按要求缴纳罚款、整改到位；若涉嫌犯罪，需委托律师介入，争取从轻情节（如自首、立功）。

1. 特殊情形：医生“兼职”药店的边界
   若医生仅作为药店投资者或管理人员，不直接参与药品销售，通常不违法；但若利用医师身份为药店引流（如向患者推荐自家药店药品），可能违反《医师法》第56条（利用职务之便牟取不正当利益），面临警告、暂停执业或吊销执照等处罚。
   处理建议：避免将诊疗行为与药店经营直接关联，保持医疗行为的独立性。

总结：医生在自家药店卖药的合法性取决于资质、行为是否符合法规。若已违规，需根据情节轻重采取整改、接受处罚或法律辩护等措施。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据材料提供针对性方案。