追溯期内的行政处罚本身不会影响追溯时效的计算，但行政处罚的作出必须发生在追溯时效期限内，否则行政机关将丧失处罚权。以下是对这一问题的详细分析：

一、行政处罚追溯时效的基本规定

根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条的规定，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。这一规定明确了行政处罚追溯时效的基本期限，以及特殊情况下的延长规定。

二、追溯时效的起算点

追溯时效的起算点对于判断行政处罚是否在追溯时效期限内至关重要。根据法律规定，追溯时效的起算点通常如下：

1. 违法行为发生之日：对于一次性实施且即时完成的违法行为，追溯时效从行为发生之日起计算。例如，某人闯红灯的行为，追溯时效即从闯红灯当日开始计算。

2. 连续状态：对于基于同一个违法故意，连续实施数个独立且触犯同一行政处罚规定的违法行为，追溯时效应从最后一次违法行为终了之日起计算。如商家连续多次销售过期食品，追溯时效从最后一次销售行为的终了之日起算。

3. 继续状态：对于违法行为及其造成的不法状态持续存在的情形，追溯时效应从违法行为终止之日起计算。如工厂持续违法排放污染物，追溯时效从停止排放之日起计算。

三、行政处罚与追溯时效的关系

1. 行政处罚必须在追溯时效期限内作出：行政机关必须在追溯时效期限内发现违法行为并作出行政处罚决定，否则将丧失处罚权。这意味着，如果行政机关在追溯时效期限内未发现违法行为，或者虽然发现了但未在期限内作出处罚决定，那么之后就不能再对违法行为进行处罚。

2. 行政处罚的作出不影响追溯时效的计算：一旦行政机关在追溯时效期限内作出了行政处罚决定，那么该处罚决定的效力就不再受追溯时效的限制。即使之后发现违法行为还有其他未被处罚的情节，或者违法行为人还有其他违法行为，也不影响已经作出的行政处罚决定的效力。当然，如果违法行为人又实施了新的同类违法行为，并且这个新行为也违反了行政管理秩序，那么对于原来的违法行为，其追溯时效可能会从新的违法行为发生之日起重新计算（即产生“时效中断”的效果），但这并不改变已经作出的行政处罚决定的效力。

四、特殊情况下的考虑

1. 涉及刑事犯罪的衔接：若违法行为同时构成犯罪，司法机关对犯罪行为进行刑事追诉的过程中，行政机关可能会中止行政处罚的时效计算，待刑事程序结束后再继续计算。但这种情况并不改变行政处罚必须在追溯时效期限内作出的基本原则。

2. 其他合理事由：如不可抗力、行政机关的原因导致无法正常开展调查等，也可能根据具体情况影响追溯时效的计算。但这些情况都需要有充分的证据支持，并且需要符合法律的规定。

总结与建议：

• 行政机关应加强对违法行为的监管和查处力度，确保在追溯时效期限内及时发现并处罚违法行为。
• 违法行为人应了解行政处罚追溯时效的相关规定，避免因为不了解法律而错过申诉或辩护的时机。
• 如果您对行政处罚追溯时效的具体应用或相关法律问题有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律解答和建议。