在双方都不能证明房产归属，但一方持有拆迁协议的情况下，法院的判决会综合考虑多种因素，并非仅依据拆迁协议直接判定房产归属。以下从不同角度为您详细分析：

1. 拆迁协议的法律效力与证明作用

   • 拆迁协议是拆迁方与被拆迁方就房屋拆迁、补偿等事宜达成的协议，它本身主要证明的是拆迁补偿的相关约定，而非直接证明房产的归属。然而，在司法实践中，拆迁协议中的被拆迁人信息往往会被视为房产归属的一个重要参考，尤其是在其他证据缺失的情况下。
   • 如果拆迁协议中明确记载了被拆迁房屋的地址、面积、产权人等信息，且这些信息与争议房产相符，那么该协议将具有一定的证明力，有助于法院判断房产的归属。

2. 双方都不能证明房产归属的情况

   • 在双方都无法提供充分证据证明房产归属的情况下，法院会依据《民法典》等相关法律法规，结合案件实际情况，进行综合判断。
   • 法院可能会考虑房产的购买、建造、使用、维护等历史情况，以及双方的经济能力、生活状况等因素，来推断房产的实际归属。

3. 拆迁协议在判决中的具体作用

   • 若拆迁协议中的被拆迁人与争议房产的登记产权人一致：在这种情况下，拆迁协议将作为强有力的证据，支持法院将房产判决给登记产权人。因为拆迁协议进一步确认了登记产权人对房产的权益。
   • 若拆迁协议中的被拆迁人与争议房产的登记产权人不一致，且双方都无法提供其他充分证据：此时，法院可能会结合拆迁协议中的其他信息（如房屋地址、面积等）与争议房产的实际情况进行比对，同时考虑双方的主张和证据，进行综合判断。如果拆迁协议中的信息与争议房产高度吻合，且一方能够合理解释为何其持有拆迁协议（如继承、赠与等），那么法院可能会倾向于将房产判决给该方。但这种情况下的判决将更加谨慎，需要充分审查双方的主张和证据。
   • 若存在其他证据能够证明房产归属：如房产买卖合同、遗嘱、公证书等，那么这些证据将优先于拆迁协议被法院采纳，作为判决房产归属的依据。

4. 法律建议

   • 对于持有拆迁协议的一方，应尽可能收集其他与房产归属相关的证据，如房产购买发票、维修记录、水电费缴纳记录等，以增强自己的主张。
   • 对于无法证明房产归属的另一方，也应积极寻找证据，如询问房产的原产权人、查找房产的相关档案等，以维护自己的合法权益。
   • 在诉讼过程中，双方应如实陈述事实，提供真实证据，避免虚假陈述或伪造证据，否则将承担相应的法律责任。

总结来说，在双方都不能证明房产归属，但一方持有拆迁协议的情况下，法院的判决将综合考虑多种因素，包括拆迁协议的内容、房产的历史情况、双方的主张和证据等。因此，无法仅凭拆迁协议就断定房产的归属。如果您面临此类纠纷，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。