结论：独资企业分配股权并另行注册新公司后，原独资企业仍然可以合法存在，但需满足一定条件并履行相应手续。

详细分析：

1. 独资企业的法律性质：

   • 独资企业，即个人独资企业，是由一个自然人投资，财产为投资人个人所有，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体。这种企业形式并不涉及股权分配的问题，因为其所有权和经营权完全集中在投资人一人手中。

2. 股权分配与新公司注册：

   • 当您提到“独资企业分配股权”并“另行注册新公司”时，这实际上可能意味着原独资企业的投资人（或部分投资人）决定与其他投资者共同出资设立一个新的公司（可能是有限责任公司或股份有限公司），并在新公司中分配股权。
   • 在这种情况下，原独资企业与新公司是两个独立的法律实体。新公司的设立和股权分配并不直接影响原独资企业的法律地位和存续。

3. 原独资企业的存续条件：

   • 合法经营：原独资企业必须继续遵守相关法律法规，进行合法经营。
   • 履行手续：如果原独资企业的投资人决定保留该企业，并继续以其名义进行经营活动，那么需要确保所有必要的年检、税务申报等手续都得到及时履行。
   • 无违法记录：原独资企业不应存在违法经营、逃税漏税等不良记录，否则可能面临行政处罚或法律诉讼，甚至被吊销营业执照。

4. 可能涉及的法律问题：

   • 资产分割：如果原独资企业的部分资产被用于投资新公司，需要确保资产分割的合法性和透明性，避免引发法律纠纷。
   • 债务承担：原独资企业和新公司应各自承担其债务责任。如果新公司的设立导致原独资企业的债务承担能力受到影响，可能需要重新评估债务风险并采取相应措施。
   • 投资人变更：如果原独资企业的投资人发生变更（例如，部分投资人退出或新投资人加入），需要按照相关法律法规办理变更登记手续。

建议：

• 在进行股权分配和新公司注册之前，建议咨询专业律师或会计师，以确保所有操作都符合法律法规要求，并避免潜在的法律风险。
• 如果您决定保留原独资企业并继续经营，请确保及时履行所有必要的法律手续和义务，以保持企业的合法存续。
• 如果您在操作过程中遇到任何法律问题或疑虑，请随时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。