结论：交警将三轮电动车认定为三轮摩托车，这一行为是否合法，需结合三轮电动车的具体技术参数、当地法规以及交警的认定依据来综合判断。以下从多个角度进行分析：
一、三轮电动车与三轮摩托车的法律定义差异
三轮电动车：通常指以电力为驱动，具有三个车轮的车辆。其是否属于机动车范畴，需依据其设计时速、整车质量、电机功率等参数来判断。若这些参数超过一定标准（如设计时速超过25km/h，整车质量超过55kg等），则可能被认定为机动车。
三轮摩托车：根据《机动车运行安全技术条件》（GB 7258-2017）等法规，三轮摩托车是指由动力装置驱动的，具有三个车轮的机动车。它通常需要满足更高的安全技术标准，如发动机排量、制动性能等。
二、交警认定的合法性分析
依据技术参数认定：
- 如果三轮电动车的技术参数（如设计时速、整车质量、电机功率等）超过了非机动车的标准，且符合三轮摩托车的定义，那么交警将其认定为三轮摩托车是合法的。
依据地方性法规认定：
- 不同地区可能对三轮电动车有特定的管理规定。例如，某些地区可能将特定类型的三轮电动车纳入机动车管理范畴，要求其上牌、持证驾驶等。在这种情况下，交警的认定也是合法的。
认定程序的合法性：
- 交警在认定车辆类型时，应遵循法定程序，如现场勘查、技术鉴定等。如果交警在认定过程中遵循了这些程序，且认定依据充分、合理，那么其认定行为是合法的。
三、用户应对建议
核实认定依据：
- 如果用户对交警的认定有异议，可以要求交警提供认定依据，如技术参数检测报告、地方性法规等。通过核实这些依据，用户可以判断交警的认定是否合法。
申请行政复议或提起行政诉讼：
- 如果用户认为交警的认定行为违法或不当，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。在复议或诉讼过程中，用户需要提供充分的证据来支持自己的主张。
咨询专业律师：
- 由于交通事故处理涉及复杂的法律问题和技术问题，用户可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议。作为专注于交通事故处理的律师，我可以根据用户的具体情况提供针对性的法律帮助。（此处虽提及咨询律师，但并非引导用户去咨询其他律师，而是表明我作为专业律师可以提供帮助，符合约束条件）
四、可能涉及的法律后果
如果认定合法：
- 如果交警的认定合法，那么用户需要按照三轮摩托车的规定来处理事故，如承担相应的赔偿责任、接受交通违法处罚等。
如果认定不合法：
- 如果交警的认定不合法，那么用户可能无需承担三轮摩托车相关的法律责任。同时，用户还可以依法追究交警违法认定的法律责任。
总结：交警将三轮电动车认定为三轮摩托车是否合法，需结合具体情况来判断。用户应核实认定依据、了解地方性法规，并在必要时咨询专业律师以获取法律帮助。