如果被诬告有人指使但没有直接证据，你可以采取以下综合措施来维护自己的合法权益，并力求澄清事实：
立即报警并详细说明情况
- 重要性：向公安机关报案是首要步骤。公安机关有责任进行侦查，搜集证据，以查明事实真相。即使没有直接证据，报警也能启动调查程序，有助于发现间接证据或线索。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百四十三条，捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究，情节严重的行为将受到法律制裁。这为你提供了法律上的保护伞。
积极收集间接证据与寻找证人
- 间接证据：尽管没有直接证据，但你可以收集被诬陷事件发生前后的相关事实，如时间、地点、在场人员等信息。例如，消费记录、监控视频、通话记录等能证明你在所谓犯罪时间在其他地方的证据，都是有力的间接证据。
- 证人证言：回忆事件发生时是否有其他人在场，并尝试找到这些人作为证人。他们的证言可能对查明事实有重要帮助，尤其是当证人能够证明你不在场或没有参与诬告行为时。
保存与诬陷相关的所有材料
- 保留信息：保存与诬陷有关的一切信息，如短信、微信聊天记录、电子邮件等。这些材料可能包含对你有利的线索，甚至能直接揭示诬告者的动机和手段。
- 分析破绽：仔细分析这些材料中的用词、语气、意图等，有时候能从中发现对方的破绽或矛盾之处，为你的辩护提供有力支持。
要求相关机关调查核实
- 提出诉求：向公安机关、纪律检查部门等相关机关如实陈述情况，并提出自己的诉求，要求他们对诬陷事件进行调查核实。这些机关有职责和权力对诬告行为进行调查，并给出公正的处理结果。
- 配合调查：积极配合调查工作，提供尽可能多的线索和信息，以便早日澄清事实。你的配合程度将直接影响调查的效率和结果。
考虑进行司法鉴定
- 专业鉴定：如果诬陷涉及专业领域的问题，如文件真伪、笔迹鉴定等，可以申请专业的司法鉴定。通过科学的鉴定方法来获取证据，以证明事实并非如对方所诬陷的那样。
- 科学证据：司法鉴定结果具有高度的权威性和可信度，能够为你的辩护提供有力的科学支持。
通过法律途径维权
- 律师代理：考虑聘请我这样的专业律师代理提起诉讼或提供法律咨询。我将协助你收集证据、分析案情、制定辩护策略，并提供专业的法律意见。
- 民事诉讼：如果诬陷行为对你的名誉、财产等造成了严重损害，你可以向法院提起民事诉讼，要求对方停止侵害、消除影响、恢复名誉、赔礼道歉并赔偿损失。
- 刑事诉讼：如果诬陷行为情节严重，构成犯罪，你还可以向公安机关报案，追究对方的刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诬告陷害他人将受到严厉的刑事制裁。
向有关行政机关申诉
- 申诉途径：除了报警和提起诉讼外，你还可以向工商、民政、文化等相关部门投诉或举报诬告行为。这些部门将根据各自的职责范围对申诉进行调查处理，并给予相应的回复。
- 行政机关职责：行政机关的介入有时能够加速问题的解决，尤其是当诬告行为涉及多个领域或部门时。
保持冷静并了解相关法律法规
- 保持冷静：在面对诬陷时，保持冷静至关重要。避免采取过激行为或发表不当言论，以免进一步损害自己的权益或给对方留下把柄。
- 了解法律：熟悉《中华人民共和国刑法》、《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关法律法规，以便在维权过程中更好地保护自己的权益。了解法律不仅能够帮助你更好地应对诬告行为，还能增强你的法律意识和自我保护能力。
在采取上述措施时，你需要注意以下几点：
- 及时行动：时间越早，收集证据和线索的机会就越大。不要拖延或等待，以免错过最佳时机。
- 保护自己：在收集证据和配合调查的过程中，要注意保护自己的安全和隐私。避免与诬告者发生直接冲突或暴露自己的行踪。
- 寻求支持：除了法律途径外，你还可以寻求家人、朋友或社会组织的支持。他们的鼓励和帮助将使你更加坚强和自信地面对诬告行为。
最后，我要强调的是，面对诬告行为时，保持冷静和理智至关重要。不要因为情绪激动而做出过激行为或发表不当言论，以免进一步损害自己的权益。相信法律的力量和公正性，积极采取措施维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。