结论：爷爷有案底且已故，一般情况下不会直接影响孙子的法律权益，但在特定情况下，如孙子希望从事某些特殊职业或参与某些特定活动时，可能会因政审等环节受到间接影响。以下是对此问题的详细分析：
一、案底对后代的一般影响
法律层面：在我国法律体系中，个人的犯罪记录（案底）主要影响的是犯罪者本人，包括其选举权、被选举权、担任某些公职的资格等。对于犯罪者的直系亲属（如子女、孙子等），法律并未直接规定其会受到何种影响。
社会层面：尽管法律没有直接规定，但在社会实践中，某些特殊职业（如公务员、军人、警察等）或特定活动（如参军、报考军校、警校等）在招生或录用时，会进行政审，考察申请人的家庭背景，包括直系亲属是否有犯罪记录。这种情况下，爷爷的案底可能会成为孙子政审时的一个不利因素。
二、案底已故对后代的影响
直接法律影响消除：由于爷爷已经去世，其犯罪记录在法律上不会继续对孙子产生直接的法律影响。例如，孙子不会因为爷爷的犯罪记录而被剥夺选举权或被选举权。
间接社会影响可能存在：尽管法律上没有直接影响，但在社会实践中，如前所述，某些特殊职业或活动的政审环节可能会考虑申请人的家庭背景。在这种情况下，即使爷爷已经去世，其犯罪记录仍可能作为政审时的一个参考因素，对孙子产生间接影响。
三、应对建议
了解政审要求：如果孙子希望从事特殊职业或参与特定活动，建议提前了解相关政审要求，明确家庭背景在政审中的具体作用。
准备相关材料：在政审过程中，如果需要提供家庭背景证明，建议孙子准备相关材料，如爷爷的死亡证明、无犯罪记录证明（如果可能）等，以证明爷爷的犯罪记录不会对孙子产生负面影响。
咨询专业人士：如果孙子对政审过程或家庭背景的影响有疑问，建议咨询相关领域的专业人士，如律师或招生官员，以获取更准确的信息和建议。
总结：爷爷有案底且已故，在一般情况下不会直接影响孙子的法律权益。但在特定情况下，如孙子希望从事特殊职业或参与特定活动时，可能会因政审等环节受到间接影响。因此，建议孙子提前了解相关政审要求，并准备相关材料以应对可能的政审环节。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。