股东合作协议书到期后是否还有效，需根据具体情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
协议本身约定
- 约定失效：若股东合作协议书中明确规定了到期自动失效，且未设置其他延续条件，那么协议在到期后自动终止，不再具有法律效力。例如，协议中写明“本协议有效期为五年，期满后自动失效”，则五年期满后，协议即失效。
- 约定延续：有些股东合作协议书可能包含自动续期或优先续约权等特殊条款。如“本协议有效期三年，期满前60日内未书面提出终止则自动延续两年”，若双方均未提出终止，协议将自动延续。
实际履行情况
- 即便股东合作协议书到期，如果股东各方仍按照原协议继续履行义务并享受权利，可视为以实际行动达成了新的合意，原协议在实际履行的范围内继续有效。例如，协议到期后，股东继续按原出资比例经营公司、分配利润和承担亏损，则相关条款在实际履行期间仍具法律效力。但需注意，这种基于实际履行的效力在证明力和稳定性上可能不如明确的书面协议，一旦发生纠纷，可能面临举证困难的问题。
法律规定
- 根据《民法典》等相关法律法规，股东合作协议书到期后的行为若符合法定合伙关系（或公司股东关系）构成要件（如共同出资、共同经营、共享收益、共担风险等），即使协议本身过期，也可能构成事实上的合伙关系（或公司股东关系）。在处理相关纠纷时，法院会依据法律关于合伙（或公司股东关系）的规定来确定各方的权利义务。
建议与风险提示：
- 及时续签或重新签订：为避免法律风险，建议在股东合作协议书到期前及时与对方协商续签或重新签订新的协议，以明确双方的权利义务。这有助于确保合作的连续性和稳定性，减少因协议过期而引发的纠纷。
- 保留实际履行证据：如果协议到期后各方仍继续履行，建议保留好相关证据，如出资记录、经营决策文件、利润分配记录等，以证明各方以实际行动达成了新的合意。
- 关注法律变化：随着法律法规的不断更新和完善，股东合作协议书的内容也可能需要相应调整。因此，建议定期关注法律变化，确保协议内容符合最新法律规定。
股东合作协议书到期后的效力问题是一个综合考量的问题，既要看协议本身的约定，也要看实际履行情况和法律规定。为确保自身权益，股东应密切关注协议的有效期，并在必要时采取相应措施。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。