机动三轮车闯红灯属于交通违法行为，将面临行政处罚，具体处理方式如下：

1. 行政处罚措施
   根据《道路交通安全法》第90条，闯红灯的机动车驾驶人将被处以20元以上200元以下罚款，并记6分。机动三轮车若被认定为机动车（需满足车辆管理标准，如时速、重量等参数），则适用此规定；若被认定为非机动车（如符合电动自行车标准），则依据第89条处罚5元以上50元以下罚款，不记分。

2. 处罚执行流程

   • 现场处罚：交警当场开具《行政处罚决定书》，需在15日内缴纳罚款，逾期每日加收3%滞纳金（最高不超过本金）。
     
   • 非现场处罚：通过电子眼抓拍或监控记录，交警部门会通过短信、邮寄等方式通知车主，需在30日内处理，否则可能影响车辆年检或驾驶证审验。

3. 特殊情形处理

   • 无证驾驶：若驾驶人未取得相应驾驶证（如D证或E证），将面临200元以上2000元以下罚款，并可处15日以下拘留。
     
   • 事故责任：若闯红灯导致交通事故，驾驶人需承担主要或全部责任，并可能涉及民事赔偿（如医疗费、车辆损失等）。若构成犯罪（如交通肇事罪），还将承担刑事责任。

4. 申诉与救济途径
   若对处罚有异议，可在收到处罚决定书后60日内向作出处罚的交警部门申请行政复议，或6个月内向法院提起行政诉讼。申诉时需提供证据（如监控录像、证人证言等）证明未闯红灯或存在法定免责事由（如避让特种车辆）。

建议：驾驶机动三轮车时务必遵守交通信号灯，若已发生闯红灯行为，建议尽快处理处罚并吸取教训。如有进一步疑问或需具体法律指导，可直接向我咨询。