部队干部被判刑两年，其处理方式会涉及多个方面，具体如下：

1. 军事司法程序：

   • 部队干部作为军人，其犯罪行为会首先由军事司法机关进行调查和审判。一旦被判刑两年，这意味着军事法院已经根据相关法律和证据，对其犯罪行为作出了有罪判决，并确定了刑罚。

2. 刑罚执行：

   • 判刑后，该干部将被送往指定的军事监狱或相关执行机构服刑。在服刑期间，他将接受相应的改造和教育，以期望其能够认识到自己的错误，重新回归社会。

3. 军籍与职务处理：

   • 根据《中国人民解放军纪律条令》等相关规定，军人被判刑后，通常会面临开除军籍的处分。这意味着他将失去军人的身份和相应的待遇。
   • 同时，其职务也会被撤销或调整。在服刑期间，他无法继续担任原职务或享受原职务带来的待遇。

4. 后续影响：

   • 判刑记录将对其个人信用和职业生涯产生严重影响。即使服刑期满，他也可能面临就业、社会认可等方面的困难。
   • 如果其犯罪行为涉及贪污、受贿等严重经济犯罪，还可能面临财产追缴等额外处罚。

5. 申诉与救济：

   • 如果该干部对判决结果有异议，他可以在法定期限内提出上诉或申诉。军事司法机关将依法进行审查，并作出相应处理。
   • 在服刑期间，如果他表现良好或有其他立功表现，也有可能获得减刑或假释等救济措施。

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