电瓶车互撞，主责方不付医疗费的情况下，您确实可以申请司法援助，但更直接且常见的做法是采取一系列法律措施来维护自己的权益。以下是从不同角度为您详细分析：
一、明确责任与义务
首先，需要明确的是，主责方支付医疗费是其应尽的法律责任和义务。在电瓶车互撞事故中，如果责任已经明确划分，主责方有义务承担相应的医疗费用，以确保伤者的紧急治疗和后续康复。
二、协商解决
直接沟通：您可以尝试与主责方进行面对面的沟通，明确指出支付医药费的必要性和紧迫性，要求其履行责任。在沟通时，保持冷静和理智，避免情绪化的行为影响问题的解决。
第三方调解：若直接沟通无果，您可以寻求社区调解委员会、交通事故调解中心等第三方的帮助，进行公正、有效的调解。调解过程中，您可以提供事故责任认定书、医疗费用证明等相关材料，以支持自己的主张。
三、申请垫付
保险公司垫付：如果电瓶车已购买保险，您可以通过交警部门联系保险公司，申请其在保险责任范围内先行垫付医疗费用。这需要您提交事故责任认定书和医疗费用证明等相关材料。
道路交通事故社会救助基金垫付：对于未参加保险或肇事后逃逸的情况，您可以根据《机动车交通事故责任强制保险条例》的相关规定，向道路交通事故社会救助基金管理机构申请垫付部分或全部抢救费用。申请时需提供交通事故认定书、医疗机构的诊断证明、费用清单等证明材料。
四、法律途径维权
向法院申请先予执行：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，您可以向法院提起民事诉讼，并同时申请先予执行，要求主责方先行支付部分或全部医药费。法院在审查后，若认为符合条件，会裁定主责方先行支付相应的费用。
起诉主责方要求赔偿：若协商和申请垫付均无果，您可以将主责方及其可能涉及的保险公司一并告上法庭，要求他们承担赔偿责任。赔偿范围包括医药费、误工费、护理费、残疾赔偿金（如构成残疾）等。诉讼过程中，您需要提供充分的证据支持自己的诉讼请求，如交通事故责任认定书、医疗费用发票、病历、诊断证明等。
五、司法援助的适用情况
虽然您提到了申请司法援助，但通常司法援助更侧重于为经济困难或特殊案件的当事人提供法律帮助。在电瓶车互撞事故中，如果您因经济困难无法承担律师费用或诉讼费用，可以向当地法律援助机构申请法律援助。然而，在大多数情况下，通过上述协商、申请垫付和法律途径维权已经足够解决问题，无需特别申请司法援助。
六、注意事项
确保费用合理且必要：在赔偿过程中，应确保所有费用都是合理且必要的，并有相关的凭证和证明文件。
及时行动：尽快采取行动收集证据、报警并与主责方协商或寻求法律途径，以免错过最佳处理时机。
作为吴根福律师，我建议您在处理此类事件时保持冷静和理智，根据实际情况选择合适的维权途径。如果您在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。