结论概述：佰维存储作为被告涉及两起侵害发明专利权纠纷案件，涉案金额合计5000万元。侵害发明专利权的认定主要依据专利权的保护范围、侵权行为的判定以及侵权责任的承担等方面。以下将结合新闻背景，从这几个方面进行详细分析。

一、专利权的保护范围

发明专利权的保护范围以其权利要求的内容为准，说明书及附图可以用于解释权利要求。在佰维存储的案例中，原告埃姆梯尔公司基于专利包中的专利提起诉讼，这意味着需要明确这些专利的具体权利要求，以确定其保护范围。法院在审理时，会仔细审查专利文件，包括权利要求书、说明书和附图，以准确界定专利权的保护范围。

二、侵权行为的判定

判定是否构成侵害发明专利权，主要看被告是否实施了以下行为之一：

1. 未经许可制造专利产品：如果佰维存储未经埃姆梯尔公司许可，制造了与专利产品相同或等同的产品，则可能构成侵权。
2. 未经许可使用专利方法：若佰维存储使用了与埃姆梯尔公司专利方法相同或等同的方法，且该方法属于专利保护范围，则也可能构成侵权。
3. 销售、许诺销售、进口专利产品或使用专利方法获得的产品：如果佰维存储销售、许诺销售或进口了由上述侵权方法获得的产品，同样可能构成侵权。

在佰维存储的案例中，法院将根据原告提供的证据，结合被告的抗辩，来判定是否存在上述侵权行为。

三、侵权责任的承担

如果法院最终认定佰维存储构成侵害发明专利权，那么佰维存储可能需要承担以下法律责任：

1. 停止侵权行为：法院会判决佰维存储立即停止制造、使用、销售、许诺销售或进口侵权产品，以及停止使用侵权方法。
2. 赔偿损失：根据《专利法》的规定，侵权人需要赔偿权利人因侵权所受到的实际损失，或者侵权人因侵权所获得的利益。在佰维存储的案例中，原告主张了2500万元的损害赔偿及合理支出费用，每起案件合计5000万元（两起案件共主张1亿元，但此处按单起案件分析，实际判决会综合考虑两起案件情况）。法院将根据双方提供的证据，结合案件具体情况，来确定最终的赔偿金额。计算公式可能涉及：实际损失=权利人因侵权所减少的销售额×单位利润；或侵权获利=侵权产品销售额×侵权产品利润率等。
3. 消除影响：如果侵权行为对权利人的商誉造成了损害，法院还可能判决侵权人承担消除影响的责任，如公开道歉等。

四、新闻背景中的法律分析

在佰维存储的案例中，原告埃姆梯尔公司基于同一专利包中的不同专利两次提起诉讼，这显示了专利纠纷的复杂性和长期性。法院在审理时，需要仔细审查每项专利的权利要求，以及被告的具体行为，来准确判定是否存在侵权。同时，佰维存储作为被告，也需要积极应对诉讼，提供充分的证据来支持自己的抗辩。

五、对公众的启示

此案例对公众，尤其是企业和创新者来说，具有以下启示：

1. 加强专利保护意识：企业和创新者应重视专利的申请和保护，确保自己的创新成果得到法律保护。
2. 谨慎使用他人专利：在使用他人专利时，应确保获得合法授权，避免侵权风险。
3. 积极应对专利纠纷：一旦面临专利纠纷，应积极应对，提供充分证据来支持自己的抗辩，以维护自身合法权益。

综上所述，侵害发明专利权的认定是一个复杂而细致的过程，涉及专利权的保护范围、侵权行为的判定以及侵权责任的承担等多个方面。在佰维存储的案例中，法院将根据相关法律法规和案件具体情况，来做出公正的判决。如果您有任何关于知识产权领域的法律问题，可以直接向我咨询。