法人将其房产租给自己公司，在符合法律规定和程序的情况下，是合法的。以下从不同角度为你详细分析：
合法性角度
合同自由原则：在民事法律关系中，合同自由是一项基本原则。法人作为房产的所有者，有权自主决定将其房产出租给谁，包括其自己所在的公司。只要双方意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，该租赁合同就是有效的。
关联交易规定：虽然法人将房产租给自己公司属于关联交易，但关联交易本身并不违法。关键在于关联交易是否公平、合理，是否损害了公司或其他股东的利益。如果租赁价格公允，交易条件公平，且经过了公司内部的决策程序（如董事会或股东会的批准），那么这种关联交易就是合法的。
潜在风险与防范
利益冲突与公平性：法人作为房产出租方和公司的一员（可能是股东、董事或高管），可能存在利益冲突。为了避免潜在的法律纠纷，建议租赁合同明确约定租赁价格、租赁期限、租金支付方式等关键条款，并确保这些条款公平合理，不损害公司或其他股东的利益。
公司决策程序：根据《公司法》的相关规定，关联交易应当经过公司内部的决策程序批准。因此，在签订租赁合同前，应确保该交易已经通过了公司董事会或股东会的批准，并留下了相应的书面记录。
税务合规：法人将房产租给自己公司，还需要考虑税务方面的问题。例如，租金收入应依法缴纳个人所得税或企业所得税；同时，公司作为承租方，也可以依法享受相关的税收优惠政策。为了确保税务合规，建议咨询专业的税务顾问或会计师。
实际操作建议
签订书面租赁合同：为了明确双方的权利和义务，避免潜在的法律纠纷，建议签订书面的租赁合同。合同中应详细约定租赁房产的基本情况、租赁期限、租金及支付方式、维修责任等关键条款。
保留相关证据：在租赁过程中，应保留好与租赁相关的所有证据，如租金支付凭证、房产维修记录等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
定期审查与更新合同：随着市场环境和公司经营状况的变化，租赁合同中的某些条款可能需要进行调整或更新。因此，建议定期审查租赁合同，并根据实际情况进行必要的修改或补充。
如果你在法人房产租赁给自己公司的过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。