结论：劳动仲裁过程中，如果被申请人是个体工商户且被注销了，仲裁是否可以继续进行需分情况讨论。若仲裁程序在公司注销前已启动且未完结，仲裁可以继续，但被申请人可能需要变更；若在公司注销后才打算申请仲裁，则通常不能直接申请，但可通过诉讼途径维护权益。
详细分析：
注销前已启动仲裁程序
- 仲裁程序继续：如果劳动者在个体工商户注销之前已经启动了劳动仲裁程序，那么仲裁会按照正常流程继续进行。这是因为仲裁程序的启动是基于双方存在的劳动关系，而注销行为并不影响已经启动的仲裁程序的效力。
- 被申请人变更：在个体工商户注销后，由于原被申请人已不存在，因此需要根据实际情况变更被申请人。若个体工商户依法进行了清算，通常由清算义务人（如业主或其指定的清算人）作为被申请人参加仲裁活动，并承担相应责任。若未经依法清算即注销，劳动者可以将原个体工商户的业主列为被申请人，要求其承担相应责任。
注销后才打算申请仲裁
- 不能直接申请仲裁：在个体工商户注销后，由于原劳动关系已终止，且不存在直接的被申请人，因此劳动者通常不能直接申请劳动仲裁。
- 诉讼途径：虽然不能直接申请仲裁，但劳动者仍可以通过诉讼途径来维护自己的权益。劳动者可以依法向法院起诉，要求原个体工商户的业主或其他相关责任人承担相应责任。在诉讼过程中，劳动者需要提供充分的证据来证明自己的主张，如劳动关系证明、工资支付记录等。
实际操作建议：
- 及时收集证据：在个体工商户出现经营异常或有注销迹象时，劳动者应及时收集与劳动关系相关的证据，如劳动合同、工资条、工作证等，以备不时之需。
- 咨询专业意见：如果劳动者对仲裁或诉讼程序不熟悉，可以向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和指导。
- 关注时效问题：无论是申请仲裁还是提起诉讼，都需要注意时效问题。根据相关法律法规的规定，劳动者应在规定的时效期内提出申请或起诉，否则可能会丧失维权的机会。
法律后果：
- 如果劳动者能够成功变更被申请人并继续仲裁程序或提起诉讼，且证据充分、主张合理，那么有可能获得相应的赔偿或补偿。
- 如果劳动者未能及时收集证据或错过时效期，可能会导致维权失败，无法获得应有的赔偿或补偿。
综上所述，虽然个体工商户注销后劳动者不能直接申请劳动仲裁，但仍有多种法律手段可供选择来维护自身权益。在实际操作中，劳动者应根据具体情况选择合适的途径，并确保自己的诉求符合法律法规。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。