公司注销时税务核查实收资本是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

税务核查的合法性基础

税务机关在公司注销过程中进行税务核查，是其依法履行职责的重要体现。根据《税收征收管理法》及其实施细则等相关法律法规，税务机关有权对纳税人的税务情况进行全面检查，包括但不限于纳税申报、税款缴纳、发票使用等方面。在公司注销时，税务机关需要确认公司是否已依法履行了所有纳税义务，包括实收资本相关的税务处理是否合规。

实收资本与税务核查的关系

实收资本是公司注册资本的一部分，代表了股东实际投入公司的资金。在公司运营过程中，实收资本的变化（如增资、减资）可能涉及税务问题，如印花税、个人所得税等。因此，在公司注销时，税务机关核查实收资本，主要是为了确认公司是否已就实收资本的变化依法缴纳了相关税款，以及是否存在利用实收资本进行偷逃税款等违法行为。

税务核查的具体内容

在公司注销时，税务机关对实收资本的核查可能包括以下几个方面：

1. 实收资本的增减变化：核查公司是否按照法律法规的规定，及时办理了实收资本的增减变更登记，并依法缴纳了相关税款。
2. 实收资本的来源与用途：确认实收资本的来源是否合法，以及是否用于了公司合法的经营活动。这有助于防止公司利用实收资本进行非法活动或逃避税务监管。
3. 实收资本与税务申报的一致性：对比公司的税务申报记录与实收资本的实际情况，确认公司是否如实申报了实收资本相关的税务信息。

合法合规的建议

为了确保公司注销时税务核查的顺利进行，建议你采取以下措施：

1. 提前整理税务资料：在公司决定注销前，提前整理好与实收资本相关的税务资料，包括增资、减资的税务处理记录、印花税缴纳凭证等。
2. 配合税务机关的核查：在公司注销过程中，积极配合税务机关的核查工作，提供必要的税务资料和解释说明。
3. 咨询专业律师或税务师：如果你对公司注销时的税务处理存在疑问或不确定的地方，建议咨询专业律师或税务师，以确保公司注销的合法性和合规性。

如果你在公司注销过程中遇到任何税务问题或法律疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。