不同意公开土地增值税清算报表的法律依据主要涉及《中华人民共和国政府信息公开条例》的相关规定，具体可从以下角度分析：

1. 涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私
   根据《政府信息公开条例》第十四条，行政机关不得公开涉及国家秘密、商业秘密、个人隐私的政府信息。若土地增值税清算报表中包含企业核心财务数据（如成本分摊方法、利润率等）或个人身份信息（如自然人股东信息），且企业明确主张该信息属于商业秘密或个人隐私，行政机关可依法拒绝公开。
   关键点：需企业提供证据证明信息符合“商业秘密”构成要件（如秘密性、价值性、保密性），或个人隐私的法定范围。

2. 公开后可能损害第三方合法权益
   依据《政府信息公开条例》第三十二条，若第三方（如纳税人）书面不同意公开且行政机关认为不公开可能对公共利益造成重大影响，需通过书面征求第三方意见程序处理。若第三方坚持反对且行政机关无法证明公开必要性，可不予公开。
   关键点：行政机关需平衡“第三方权益”与“公共利益”，若报表公开仅涉及个别企业且无公共利益关联（如不涉及政策调整、行业监管等），第三方反对意见可能被采纳。

3. 属于行政机关内部管理信息或过程性信息
   根据《政府信息公开条例》第十六条，行政机关的内部事务信息（如内部审批流程、会议纪要）和过程性信息（如尚未定稿的清算报告）可不公开。若土地增值税清算报表仍处于审核阶段或仅作为内部参考，可能被认定为过程性信息。
   关键点：需区分“最终清算结论”与“过程性报表”，前者通常需公开，后者可依法不公开。

4. 法律、法规另有规定
   若《税收征收管理法》及其实施细则等专项法律对税务信息保密有更高层级规定（如《税收征收管理法》第八条明确“纳税人、扣缴义务人有权要求税务机关为纳税人、扣缴义务人的情况保密”），可优先适用专项法律拒绝公开。
   关键点：需核查税务领域是否有排除政府信息公开的特别规定。

实务建议：

• 若企业主张不公开，需结合报表内容选择上述依据，并准备证据（如商业秘密鉴定报告、第三方反对函等）；
  
• 若行政机关拒绝公开，申请人可依据《政府信息公开条例》第五十一条提起行政复议或行政诉讼，要求撤销不予公开决定。
  

注：具体适用需结合报表内容、公开主体、公开程序等个案因素综合判断，建议提供详细信息进一步分析。