结论：业委会不让业主自由进出小区，一般情况下是不合法的，但存在特殊情形。以下从不同角度进行分析：
合法性分析
业主的通行权：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，业主对建筑物内的住宅、经营性用房等专有部分享有所有权，对专有部分以外的共有部分享有共有和共同管理的权利。小区的大门及通行道路属于业主共有部分，业主有权自由进出。
- 业委会作为业主大会的执行机构，其职责是执行业主大会的决定事项，维护业主的合法权益。业委会无权擅自剥夺业主的通行权。
业委会的权限：
- 业委会的权限来源于业主大会的授权，且必须在法律、法规和业主管理规约的框架内行使。如果业委会试图限制业主的通行权，必须得到业主大会的明确授权，并且这种限制必须合理、必要，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 在没有业主大会明确授权，且无法律、法规依据的情况下，业委会不得擅自设置通行限制。
特殊情形分析
疫情防控等紧急情况：
- 在疫情防控等紧急情况下，为了维护公共利益和业主的安全，业委会可能会根据政府的相关规定和要求，采取必要的通行限制措施。但这种限制必须是暂时的、合理的，并且应当及时向业主公告和解释。
- 在紧急情况结束后，业委会应当及时恢复业主的通行权。
业主违反管理规约：
- 如果业主违反了小区的管理规约，如乱停乱放车辆、破坏公共设施等，业委会可以依据管理规约的规定，对业主采取相应的管理措施。但这些措施应当与业主的违规行为相适应，且不得侵犯业主的基本权利，如通行权。
- 如果业委会认为需要限制业主的通行权作为管理措施，必须得到业主大会的明确授权，并且这种限制必须合理、必要。
法律建议
与业委会沟通：
- 如果业主认为业委会的限制措施不合理或违法，可以先与业委会进行沟通，了解限制的原因和依据，并尝试协商解决。
向相关部门投诉：
- 如果沟通无果，业主可以向当地的房地产管理部门、街道办事处或乡镇人民政府等相关部门投诉，寻求帮助和调解。
法律途径：
- 如果问题仍然无法解决，业主可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼，要求业委会停止侵权行为并赔偿损失。
后续行动建议：业主在遇到此类问题时，应保留好相关证据，如通行限制的通知、与业委会的沟通记录等，以便在需要时提供证明。同时，业主也应积极了解小区的管理规约和相关法律法规，以便更好地维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。