针对修高标准农田侵害其他农田的问题，主要由农业农村主管部门、自然资源部门以及可能涉及的生态环境部门进行管理，具体需根据侵害的性质和程度来确定责任主体。以下从不同侵害情形及责任主体、维权途径等方面进行详细分析：

一、不同侵害情形及责任主体

1. 土地规划与审批环节的问题

   • 情形：若高标准农田建设项目在规划或审批阶段，未充分考虑周边农田的权益，导致其他农田受到侵害（如排水不畅、灌溉受阻等）。
   • 责任主体：农业农村主管部门（负责农田建设规划）和自然资源部门（负责土地利用总体规划）可能需承担责任。它们应确保项目规划符合土地利用总体规划和农田保护要求，避免对周边农田造成不利影响。

2. 施工过程中的侵害

   • 情形：在施工过程中，因施工不当（如挖掘、填埋等）导致其他农田受损。
   • 责任主体：施工单位是直接责任人，需承担修复或赔偿责任。同时，若农业农村主管部门或自然资源部门在监管过程中存在疏忽，也可能需承担一定的监管责任。

3. 项目运营后的长期影响

   • 情形：高标准农田建成后，因排水系统设计不合理或管理不善，导致周边农田长期受淹或盐碱化。
   • 责任主体：项目运营方（可能是农业农村主管部门、地方政府或相关企业）需承担主要责任。它们应负责项目的长期维护和管理，确保不对周边农田造成长期不利影响。

4. 生态环境破坏

   • 情形：若高标准农田建设过程中破坏了生态环境（如湿地、林地等），导致其他农田的生态功能受损。
   • 责任主体：生态环境部门需介入调查，并根据破坏程度对责任方进行处罚。同时，农业农村主管部门和自然资源部门也需在各自职责范围内，确保农田建设不破坏生态环境。

二、维权途径

1. 协商与调解

   • 步骤：首先，受侵害的农田所有者或使用者可以尝试与责任方（如施工单位、项目运营方等）进行协商，寻求解决方案。若协商无果，可以请求当地农业农村主管部门或自然资源部门介入调解。

2. 行政投诉与举报

   • 步骤：若协商和调解均未能解决问题，受侵害方可以向当地农业农村主管部门、自然资源部门或生态环境部门进行投诉或举报。这些部门将依法对投诉或举报进行调查处理，并可能对责任方进行行政处罚。

3. 法律诉讼

   • 步骤：在行政途径无法解决问题的情况下，受侵害方可以向人民法院提起民事诉讼，要求责任方承担修复或赔偿责任。在诉讼过程中，受侵害方需提供充分的证据证明其农田受到侵害的事实及损失程度。

三、建议与注意事项

1. 保留证据：在发现农田受到侵害后，受侵害方应及时保留相关证据（如照片、视频、检测报告等），以便在协商、调解或诉讼过程中证明其权益受到侵害的事实。
2. 了解政策：受侵害方应了解当地关于农田保护、土地利用和生态环境保护的相关政策法规，以便在维权过程中更好地维护自己的权益。
3. 寻求专业帮助：在维权过程中，受侵害方可以寻求专业律师或农业技术人员的帮助，以提高维权的效率和成功率。