申请提前还款时，违约金是否会显示，取决于贷款合同的具体约定以及贷款机构的告知方式，但通常会在合同中明确约定，并在实际操作环节有所体现。具体分析如下：

1. 合同约定层面：在签署贷款合同时，合同中会明确约定提前还款的相关条款，包括是否收取违约金、违约金的计算方式等。因此，如果合同中有约定违约金，那么在申请提前还款时，违约金的相关条款是已经存在且明确的。借款人可以在签署合同前仔细阅读相关条款，了解提前还款可能产生的费用。

2. 贷款机构告知层面：在实际操作中，贷款机构通常会在借款人申请提前还款时，明确告知其需要支付的违约金金额或计算方式。这种告知可能通过书面形式（如提前还款通知书）或口头形式进行，但无论如何，借款人都有权要求贷款机构提供明确的违约金信息。

3. 特殊情况：也存在一些贷款机构在合同中未明确约定违约金，但在实际操作中要求借款人支付一定费用的情况。这种情况下，借款人有权要求贷款机构提供合理的解释和依据，并可以咨询法律专业人士以维护自己的合法权益。