结论：仅因曾经使用虚假合同办理工商登记，但后续已经变更为真实合同这一情况，并不必然导致营业执照被吊销。是否吊销营业执照需根据具体情节、造成的后果以及相关法律法规的规定，由工商行政管理部门综合判断决定。

分析说明：

1. 虚假合同办理工商登记的法律性质：

   • 使用虚假合同办理工商登记属于违法行为，可能涉及欺诈、虚假陈述等法律责任。这种行为破坏了市场秩序，损害了其他市场主体的合法权益，因此受到法律的严格规制。

2. 后续变更为真实合同的影响：

   • 后续将虚假合同变更为真实合同，表明当事人有纠正违法行为的意愿和行动。然而，这一行为并不能完全消除之前使用虚假合同办理工商登记的违法性。工商行政管理部门在考虑是否吊销营业执照时，会综合考虑违法行为的性质、情节、后果以及当事人的整改情况等因素。

3. 吊销营业执照的法定条件：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规的规定，吊销营业执照通常是在公司存在严重违法行为，如长期不经营、严重违反法律法规、欺诈登记等情况下，由工商行政管理部门依法作出的行政处罚。
   • 具体到本案，如果使用虚假合同办理工商登记的行为并未造成严重后果，且当事人已经及时纠正并变更为真实合同，那么工商行政管理部门可能不会直接吊销营业执照，而是会采取其他行政处罚措施，如罚款、警告等。

4. 工商行政管理部门的自由裁量权：

   • 工商行政管理部门在处理此类案件时，享有一定的自由裁量权。他们会根据违法行为的性质、情节、后果以及当事人的整改情况等因素，综合判断是否吊销营业执照。因此，即使存在使用虚假合同办理工商登记的历史，也不一定必然导致营业执照被吊销。

法律建议：

• 如果您或您的公司曾经使用虚假合同办理工商登记，但后续已经变更为真实合同，建议您主动向工商行政管理部门说明情况，并提交相关证明材料，以表明您已经纠正了违法行为。
• 同时，您应密切关注工商行政管理部门的处理结果，如果收到行政处罚决定书或其他法律文书，应及时咨询专业律师，了解您的权利和义务，并采取相应的法律措施。
• 在未来的经营活动中，您应严格遵守法律法规，确保所有经营行为的合法性和合规性，以避免类似问题的再次发生。

后续行动建议：

• 如果您对工商行政管理部门的处理结果有异议，可以在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，以维护您的合法权益。
• 在处理此类法律问题时，建议您寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。