将宠物骨灰埋在树下且不留包玻璃杯的行为，其合法性主要取决于具体的地点和当地的法律法规以及管理规定。以下是从不同角度进行的分析：
公共区域（如公园、街道旁等）：
- 在公共区域，土地的使用和管理通常受到严格的法律法规约束。未经许可，在公共区域埋葬宠物骨灰可能违反土地管理、环境保护或公共卫生等相关法规。
- 即使不留包玻璃杯，这种行为也可能被视为对公共土地的不当使用，可能面临管理部门的处罚或要求移除。
私人土地（如自家院子、私人花园等）：
- 在私人土地上，土地所有者通常有权决定如何使用其土地，包括埋葬宠物骨灰。但需注意，即使是在私人土地上，也应遵守当地关于环境保护、公共卫生或土地使用的相关规定。
- 如果埋葬行为不会对环境造成污染，也不会对他人造成不便或影响，那么这种行为在私人土地上通常是合法的。
特定管理区域（如小区绿地、墓地等）：
- 在这些区域，土地的使用和管理通常受到特定规定或合同的约束。例如，小区绿地可能由物业管理公司负责管理，其使用需遵循小区的规定。
- 在墓地等特定区域，埋葬行为需遵循墓地的管理规定和当地的相关法规。
法律建议：
- 在决定将宠物骨灰埋在何处之前，建议先了解当地的相关法律法规和管理规定，以确保行为的合法性。
- 如果是在公共区域或特定管理区域，最好事先与管理部门或相关机构进行沟通，获得许可后再进行埋葬。
- 在私人土地上埋葬时，也应确保不会对环境造成污染或对他人造成不便。
可能的法律后果：
- 如果未经许可，在公共区域或特定管理区域埋葬宠物骨灰，可能面临管理部门的处罚，包括罚款、要求移除等。
- 如果埋葬行为对环境造成了污染或对他人造成了损害，还可能承担相应的民事责任或刑事责任。
总之，将宠物骨灰埋在树下且不留包玻璃杯的行为，其合法性取决于具体的地点和当地的法律法规以及管理规定。在做出决定之前，请务必了解并遵守相关规定，以避免不必要的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。