关于电单车醉驾罚款是否会有案底的问题，这主要取决于醉驾行为是否构成了刑事犯罪。

首先，我们需要明确的是，在一般情况下，电单车（电动车）受到的普通行政处罚，如因闯红灯、逆行、未在规定车道行驶等交通违法行为而受到的警告或罚款，是不会留下案底的。这些处罚记录会保存在交通管理部门的系统中，主要用于对违法者进行教育和惩戒，但并不属于刑法意义上的“案底”，因此通常不会对个人的升学、就业、参军等产生实质性影响。

然而，当电单车醉驾行为构成刑事犯罪时，就会留下案底。具体来说，如果电单车被认定为机动车范畴（这取决于当地的具体法规和电单车的实际性能参数），且驾驶者醉酒驾驶（血液酒精含量达到80毫克/100毫升以上），达到了危险驾驶罪的标准，那么一旦被追究刑事责任，就会在个人刑事档案中留下案底。这种案底将对个人的生活、工作、学习等方面产生严重影响，如可能导致就业困难、限制某些职业资格的取得等。

此外，即使电单车醉驾行为未构成刑事犯罪，但相关的违章记录仍然会在公安机关交通管理部门有所保存。这些记录虽然不会自动消除，但在大多数情况下，对个人的日常生活不会产生直接影响。不过，在报考公务员、警校或进行其他涉及政审的环节时，这些记录可能会被作为考量因素之一。

总结与建议：

1. 电单车醉驾罚款是否会有案底，取决于醉驾行为是否构成刑事犯罪。
2. 在一般情况下，电单车受到的普通行政处罚不会留下案底，但相关记录在公安机关会有留存。
3. 如果电单车醉驾行为构成刑事犯罪，则会在个人刑事档案中留下案底，并可能带来严重的后果。
4. 建议电单车驾驶者严格遵守交通法规，避免醉酒驾驶等违法行为的发生，以确保自身权益不受损害。

如果您对电单车醉驾的具体法律后果或相关法规有进一步的疑问，建议咨询当地公安部门或专业律师以获取更准确的信息和法律建议。