违规借贷案件即使已还清且未获利，立案后仍可能面临行政处罚或刑事责任追诉，但处理方式会根据具体情节存在差异。以下从行政违法与刑事犯罪两个角度展开分析：

一、若属于行政违法（如违反《民间借贷规定》等）

1. 处罚可能性
   即使借贷资金已还清且无获利，若存在“套取金融机构信贷资金转贷”“未依法取得放贷资格以营利为目的向社会不特定对象提供借款”等行为，仍可能被认定为行政违法。根据《防范和处置非法集资条例》第三十九条，可能面临没收违法所得、罚款（违法所得1倍以上10倍以下）等处罚。

2. 处理流程

   • 立案调查：公安机关或金融监管部门立案后，会调查借贷资金来源、放贷对象范围、是否形成“职业放贷”等情节。
     
   • 行政处罚决定：若认定违法，会出具《行政处罚决定书》，明确处罚类型（如罚款、没收）及金额。
     
   • 执行与救济：当事人需在规定期限内缴纳罚款或接受其他处罚；若不服处罚，可申请行政复议或提起行政诉讼。

3. 关键情节影响

   • 资金来源：若资金来自银行贷款后转贷，即使未获利，也可能因“高利转贷”被处罚。
     
   • 放贷对象：向不特定多人放贷可能被认定为“职业放贷”，加重处罚。
     
   • 社会危害性：若借贷行为引发群体性事件或严重扰乱金融秩序，处罚力度可能更大。

二、若涉嫌刑事犯罪（如非法经营罪、高利转贷罪等）

1. 刑事追诉风险
   即使借贷已还清且无获利，若符合以下情形，仍可能被追究刑事责任：

   • 非法经营罪：违反国家规定，未经监管部门批准，经常性地向社会不特定对象发放贷款，扰乱金融市场秩序，情节严重的（如个人非法放贷数额累计200万元以上，或违法所得80万元以上）。
     
   • 高利转贷罪：以转贷牟利为目的，套取金融机构信贷资金高利转贷他人，违法所得数额较大（如10万元以上）的，即使实际未获利，但若存在“套取资金”行为，仍可能构成犯罪未遂或既遂。

2. 刑事处理流程

   • 刑事立案：公安机关认为符合犯罪构成要件时，会立案侦查，采取强制措施（如取保候审、拘留）。
     
   • 侦查与审查起诉：公安机关收集证据后，移送检察院审查起诉；检察院决定是否提起公诉。
     
   • 法院审判：若起诉，法院会根据证据认定是否构成犯罪及量刑情节（如自首、立功、认罪认罚等）。

3. 关键辩护点

   • 主观故意：若能证明无“以营利为目的”或“套取资金转贷”的主观故意，可能不构成犯罪。
     
   • 情节轻微：若借贷次数少、金额小、未造成严重后果，可争取不起诉或缓刑。
     
   • 证据瑕疵：若资金来源、放贷对象等证据存在矛盾，可能影响犯罪认定。

三、实务建议

1. 主动配合调查：立案后，应如实向办案机关说明借贷资金来源、用途、还款情况等，避免隐瞒或虚假陈述。
   
2. 收集证据：整理还款凭证、借贷合同、沟通记录等，证明无获利目的及社会危害性。
   
3. 咨询专业律师：根据案件性质（行政或刑事），制定辩护策略，争取从轻或免除处罚。
   

总结：违规借贷已还清且未获利，并不必然免除法律责任。具体处理需结合行为性质、情节严重程度及证据情况综合判断。建议尽快委托律师介入，通过法律程序维护权益。