当劳动合同到期且用人单位决定不续签时，关于加班的赔偿问题，实际上主要涉及到的是经济补偿的计算与支付，而加班工资本身并不直接作为赔偿项目，但会影响经济补偿的计算基数。以下是对此问题的详细解答：
一、赔偿依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，除用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，而劳动者不同意续订的情形外，当劳动合同因期满而终止时，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。
二、经济补偿的计算与加班工资的关系
基本计算方式：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
月工资的定义与加班工资的影响：
- 月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。这里需要注意的是，月工资的计算应包含劳动者正常出勤情况下的应得工资，但需扣除加班工资、非常规性奖金等收入中的非固定部分（不过，在实际操作中，若加班工资是劳动者工资的固定组成部分，且长期、稳定地支付，则可能被纳入月工资的计算基数中，这需根据具体情况和地方规定来判断）。然而，在大多数情况下，为了准确反映劳动者的正常收入水平，加班工资在计算月工资时通常会被排除在外，或者按照一定比例进行折算（如果地方有具体规定的话）。但更常见的做法是，在计算经济补偿的月工资基数时，先确定劳动者正常出勤情况下的应得工资（不包括加班工资等非固定收入），然后再根据这个基数来计算经济补偿。
- 如果劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
特殊情形下的月工资计算：
- 若劳动者工作不满12个月，则按照实际工作的月数计算平均工资。
- 若劳动者在合同终止前存在病假、停工等非正常工作情形，导致工资低于正常出勤期间的工资，在计算月工资时，应以正常出勤情况下的应得工资（同样需考虑加班工资的处理方式）作为计算基数。
三、关于加班工资的单独说明
虽然加班工资不直接作为经济补偿的赔偿项目，但劳动者在劳动合同期间内的加班工资是应得的合法收入。如果用人单位未按照法律规定支付加班工资，劳动者有权要求用人单位补发，并可以在申请劳动仲裁或提起诉讼时，将加班工资的支付情况作为争议焦点之一。
四、赔偿程序与注意事项
协商沟通：
- 在劳动合同到期前，用人单位应与劳动者就续签事宜进行协商。若双方无法达成一致，用人单位应提前通知劳动者不续签的决定，并说明理由。
办理离职手续：
- 劳动合同终止后，用人单位应为劳动者办理离职手续，包括出具离职证明、转移社保关系等。
支付经济补偿：
- 用人单位应在办结工作交接时，按照约定的时间或法律规定的时间向劳动者支付经济补偿。
保留证据与及时维权：
- 劳动者应妥善保管与用人单位签订的劳动合同、工资条（包括加班工资记录）、考勤记录等证据材料。
- 若用人单位拒绝支付经济补偿或未按照规定支付（包括未正确计算月工资基数导致经济补偿不足），劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的权益。
综上所述，当劳动合同不续签时，劳动者主要关注的是经济补偿的支付问题，而加班工资虽然不直接作为赔偿项目，但会影响经济补偿的计算基数。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取法律措施来维护自己的合法权益。