结论前置：违反程序定的合同是否有效，不能一概而论，其效力需根据违反的程序规定的性质、合同的具体情况以及相关法律法规的规定来判断。
一、合同效力的基本原则与分类
根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为原则上无效，但这里的“强制性规定”需要区分是效力性强制规定还是管理性强制规定。
效力性强制规定：
- 若合同违反的是效力性强制规定，即直接损害国家利益或社会公共利益的程序规定，那么该合同将自始无效。例如，若合同签订程序违反了法律关于必须公开招标的规定，而该招标项目涉及国家重大利益，那么该合同可能因违反效力性强制规定而无效。
管理性强制规定：
- 若合同违反的是管理性强制规定，即旨在管理和处罚违反行为的程序规定，但并不直接否定行为的民商法效力，那么该合同在补正或满足一定条件后，可能仍然有效。例如，某些行业需要特定的资质或许可才能从事经营活动，若合同签订时未取得相关资质或许可，但后续能够补正，则合同可能仍然有效。
二、合同部分无效与整体无效的区别
- 当合同仅部分违反程序规定时，若该违反部分可独立分离，不影响其他部分的履行和效力，则其他部分仍可有效。例如，合同中关于争议解决方式的条款违反了程序规定，但该条款并不影响合同其他部分的履行，那么其他部分仍然有效。
三、合同违反程序规定的法律后果
合同整体无效的处理：
- 若合同被认定为整体无效，行为人因该合同取得的财产应予以返还；不能返还或无需返还的，应折价补偿。同时，有过错的一方应赔偿对方因此遭受的损失；各方均有过错的，各自承担相应责任。
部分条款无效的处理：
- 对于部分无效的合同，有效部分继续履行，违法部分按照无效合同的规则处理责任承担问题。例如，调整因违反程序规定而无效的条款，并据此确定双方的权利义务。
四、实际操作建议
仔细审查合同签订程序：
- 在签订合同前，务必对合同签订的程序进行详细审查，确保符合法律法规的要求。特别是涉及重大利益或公共利益的合同，更应谨慎对待。
及时补救与调整：
- 若发现合同签订程序可能存在违反规定的情况，应立即采取措施进行补救或调整。例如，申请相关许可、补正手续或修改合同条款等。
寻求法律帮助：
- 在处理复杂的合同纠纷时，建议及时向我咨询，以便准确判断合同的效力状态，并采取相应措施保护自身权益。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份建设工程施工合同，但该合同未经公开招标程序即签订，而该工程属于必须公开招标的项目。在此情况下，若该招标程序属于效力性强制规定，则该合同可能因违反程序规定而无效。但若甲乙双方在合同签订后能够补正公开招标程序，并取得相关部门的批准，则该合同可能仍然有效。
综上所述，违反程序定的合同是否有效需根据具体情况来判断。在处理此类问题时，应综合考虑违反的程序规定的性质、合同的具体情况以及相关法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。