在醉驾案件中，若存在血样封装不规范、行政强制措施凭证违法开具以及未低温保存血样等情形，法院在判决时会综合考量这些程序违法行为的严重程度及其对案件公正性的影响，可能作出以下判决或处理：

1. 若程序违法行为轻微，不影响案件基本事实的认定：

   • 法院可能认为，尽管存在血样封装不规范、行政强制措施凭证开具不当或未低温保存血样等程序瑕疵，但这些瑕疵并未对血液酒精含量的检测结果产生实质性影响，也未剥夺被告人的基本诉讼权利。
   • 在此情况下，法院可能会依据检测出的血液酒精含量，结合其他证据，如驾驶行为、现场情况等，认定被告人构成危险驾驶罪，并依法判处相应的刑罚，如拘役、罚金等。

2. 若程序违法行为严重，影响案件公正性：

   • 如果血样封装不规范、行政强制措施凭证违法开具或未低温保存血样等行为，导致血液酒精含量的检测结果不可靠，或者剥夺了被告人的基本诉讼权利，如申请重新鉴定、质证等，那么这些程序违法行为将严重影响案件的公正性。
   • 在此情况下，法院可能会根据《刑事诉讼法》的相关规定，如“非法证据排除规则”，排除因程序违法而获得的血液酒精含量检测结果作为定案的依据。
   • 如果排除该证据后，其他证据不足以证明被告人构成危险驾驶罪，法院可能会判决被告人无罪，或者因证据不足而裁定驳回起诉。

3. 若程序违法行为可补正或合理解释：

   • 在某些情况下，虽然存在程序违法行为，但如果能够通过补正或合理解释来消除其影响，法院可能会考虑采纳相关证据。
   • 例如，如果血样封装不规范但能够证明血样未被污染或替换，或者行政强制措施凭证开具不当但能够证明强制措施的合法性和必要性，法院可能会在综合考虑其他证据的基础上，对案件作出判决。

在处理此类案件时，法院还会关注以下方面：

• 被告人的权利保障：法院会确保被告人在诉讼过程中的基本权利得到保障，如申请回避、申请重新鉴定、质证等。
• 证据的合法性和关联性：法院会严格审查证据的合法性和关联性，确保只有合法、有效的证据才能作为定案的依据。
• 案件的社会影响：法院在判决时也会考虑案件的社会影响，如醉驾行为的危害性、公众对醉驾的认知态度等，以维护社会的公平正义和公共安全。

建议：如果您或您身边的人涉及此类醉驾案件，且存在程序违法等复杂情况，建议及时咨询专业律师，以便更全面地了解案件的法律风险和可能的判决结果，并制定相应的辩护策略。