关于起诉女方配合办理公司股权变更登记的管辖问题，结论如下：

1. 一般原则：被告住所地法院管辖
   根据《民事诉讼法》第22条，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地（即女方户籍所在地）法院管辖。若女方离开住所地超过1年，且在现居住地连续居住满1年，可由现居住地法院管辖（需提供居委会/派出所证明）。

2. 特殊情形：协议管辖或专属管辖的适用

   • 协议管辖：若离婚协议中明确约定“因履行协议产生的纠纷由某地法院管辖”（如公司所在地、原婚姻登记地等），且该约定不违反级别管辖和专属管辖，可向约定法院起诉。
     
   • 专属管辖：若股权变更涉及公司注册地（如需以公司为第三人办理变更登记），部分法院可能认为公司注册地法院有管辖权，但实践中仍以被告住所地为主。
     

3. 实务建议：优先选择被告住所地，同步准备协议管辖证据

   • 步骤1：查询女方户籍信息（可通过离婚协议、户口本复印件或委托律师调取），确定被告住所地。
     
   • 步骤2：检查离婚协议是否约定管辖条款，若有则同步准备协议原件作为证据。
     
   • 步骤3：若女方下落不明，需先通过法院宣告失踪（需公告程序），再以“无/限制民事行为能力人监护人”为被告起诉，此时管辖可能涉及监护人住所地。
     

补充说明：

• 起诉时需提交材料：起诉状、离婚协议原件、公司股权登记证明、女方下落不明的证明（如居委会/派出所证明、公告送达记录等）。
  
• 若女方拒不配合，法院可判决其履行义务，但执行阶段仍需公司配合（如出具股东会决议、修改章程等），建议同步与公司沟通。
  

如有进一步细节（如离婚协议具体条款、公司类型等），可随时补充说明，我会为您细化分析。