出租车在高速公路上被扣12分，驾驶员需按照以下步骤处理，具体分为两种情况：

1. 确认违法行为及扣分依据
   根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第八条，高速公路上常见的扣12分行为包括：

   • 驾驶机动车在高速公路上倒车、逆行、穿越中央分隔带掉头；
     
   • 驾驶营运客车（包括出租车）在高速公路车道内停车；
     
   • 驾驶中型以上载客载货汽车、校车、危险物品运输车辆在高速公路上行驶超过规定时速20%以上。
     建议：驾驶员需通过交管12123APP或当地交警部门查询具体违法记录，确认扣分原因及处罚依据。

2. 处理流程与后果

   • 扣证与学习：驾驶证被扣12分后，交警部门将扣留驾驶证，驾驶员需在15日内参加为期7日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习（可通过“交管12123”预约）。
     
   • 考试要求：学习完成后，需参加科目一考试（满分100分，90分合格）。考试合格后，记分清除，发还驾驶证；若不合格，需重新学习并考试。
     
   • 营运车辆特殊规定：若出租车驾驶员的违法行为涉及营运车辆（如超速20%以上或高速车道内停车），部分地区可能要求额外参加营运车辆安全培训，或由运输企业暂停其营运资格直至考试合格。
     

3. 对职业的影响

   • 短期影响：扣12分期间，驾驶员不得继续驾驶出租车，需等待记分清除后重新上岗。若企业有内部规定，可能面临警告、罚款或停运处罚。
     
   • 长期影响：若违法行为涉及危险驾驶（如高速逆行），可能被纳入交通信用失信记录，影响未来从业资格（如出租车驾驶员资格证年审）。
     

温馨提示：

• 若对扣分有异议，可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。
  
• 日常驾驶中，建议出租车驾驶员使用导航提醒限速，避免高速车道内随意停车，严格遵守交通规则。
  

如有其他细节需要进一步分析（如具体违法行为、地区差异等），可直接向我咨询。