结论：民政局没有结婚证档案是否能起诉离婚，关键在于能否证明婚姻关系的实际存在。若能证明存在有效的婚姻关系，即便没有结婚档案，也可按相应程序办理离婚或处理相关事宜；若无法证明存在有效的婚姻关系，则无需办理离婚手续。以下是对此问题的详细分析：
一、婚姻关系的法律认定
婚姻关系的成立以在民政部门登记为准，只有经过合法登记的婚姻，才受到法律保护。如果民政局没有结婚档案，可能表明双方并未进行合法的婚姻登记，或者登记信息丢失、未录入系统。
二、无需离婚的情况
未办理结婚登记：
- 如果双方从未至民政部门办理结婚登记，仅举办民间婚礼等，那么在法律上，双方并不构成夫妻关系，而是同居关系。
- 同居关系不受婚姻法保护，解除时也不需要办理离婚手续。双方可自行协商分开，并就财产分割、子女抚养等问题达成协议。
1994年2月1日后的同居关系：
- 根据相关法律规定，1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方虽然符合结婚实质要件，但未补办结婚登记的，按照同居关系处理。
- 在这种情况下，双方无需办理离婚手续，可自行解除同居关系。若因同居期间产生的财产分割、子女抚养等问题发生争议，可向人民法院提起诉讼以解决相关纠纷。
三、需要离婚的情况
1994年2月1日前的事实婚姻：
- 如果男女双方在1994年2月1日《婚姻登记管理条例》公布实施前，已符合结婚实质要件（即双方具有结婚意愿且共同生活），则视为事实婚姻。
- 在这种情况下，双方需要办理离婚手续。可以选择协议离婚，即就子女抚养、财产分割等问题达成一致后，前往法院通过调解方式办理；若无法达成协议，则需通过诉讼离婚，由法院判决是否准予离婚及处理相关问题。
结婚档案丢失但能证明婚姻关系：
- 如果双方曾经办理过结婚登记，但因档案管理问题导致结婚档案遗失，且能通过其他方式（如结婚证、共同生活证据等）证明婚姻关系的存在，那么双方可以按照正常离婚程序办理离婚手续。
- 在这种情况下，双方可以选择协议离婚或诉讼离婚。若选择协议离婚，需就子女抚养、财产分割等问题达成一致；若选择诉讼离婚，则需向法院提起诉讼，由法院判决是否准予离婚及处理相关问题。
四、建议与指导
核实婚姻状况：
- 建议双方先核实婚姻状况，确认是否存在有效的婚姻关系。可以通过查询民政局的婚姻登记记录、查找结婚证等方式进行。
收集证据：
- 如果民政局没有结婚档案，但双方认为存在有效的婚姻关系，那么应尽可能收集其他证据来证明婚姻关系的存在，如结婚证（如果丢失可尝试补办或查找复印件）、婚礼照片、共同生活的证据（如共同居住的房屋租赁合同、水电费缴纳记录等）、证人证言等。
协商或诉讼：
- 根据婚姻关系的实际情况和双方的意愿，选择协商或诉讼的方式解决离婚问题。如果双方能够就子女抚养、财产分割等问题达成一致，可以选择协议离婚；如果无法达成一致，则需要通过诉讼离婚的方式解决。
在处理涉及婚姻、家庭的事务时，应尽量保持冷静和理性，通过合法途径解决争议，维护自身合法权益。如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。