银行存款未能序时登记，这一行为主要违反了《会计基础工作规范》以及《中华人民共和国现金管理暂行条例》中的相关规定。

首先，根据《会计基础工作规范》第五十六条，各单位应当按照国家统一会计制度的规定和会计业务的需要设置会计账簿，这其中包括了日记账，如《现金日记账》和《银行存款日记账》。而第五十七条进一步明确指出，现金日记账和银行存款日记账必须采用订本式账簿，并且不得用银行对账单或者其他方法代替日记账。这意味着，银行存款的变动必须逐日、逐笔地在《银行存款日记账》中进行登记，以确保账目的清晰和准确。

其次，《中华人民共和国现金管理暂行条例》（2011修订）第十二条也规定，开户单位应当建立健全现金账目，逐笔记载现金支付，并且账目应当日清月结，账款相符。虽然这一条款主要针对的是现金账目，但其原则同样适用于银行存款的账目管理，即要求账目的登记必须及时、准确，以反映真实的财务状况。

银行存款未能序时登记，就可能导致账目不清、账款不符等问题，进而影响到财务信息的真实性和准确性。这不仅违反了上述的会计法规和规范，也可能给单位带来财务风险和法律责任。

因此，对于银行存款的登记工作，必须严格按照相关法规和规范的要求进行，确保账目的清晰、准确和完整。如果发现存在违规行为，应及时进行整改，并接受相关部门的监督和处罚。