政府进行土地公证时承包人不在场，该公证是否有效需分情况讨论：

1. 若公证事项不涉及承包人核心权益或承包人已授权
   根据《公证法》第26条，公证申请可由当事人本人办理，也可委托他人代理。若承包人已通过书面授权委托他人代为办理公证，或公证事项仅涉及土地权属登记、流转程序性手续（如政府单方确认土地现状），且不直接处分承包人权益（如转让、抵押），则承包人未到场不影响公证效力。此时公证机构可依据授权文件或政府提交的合法材料出具公证书。

2. 若公证事项直接处分承包人权益且未获授权
   若公证内容涉及土地承包经营权转让、抵押、继承等直接处分承包人财产权益的行为，根据《民法典》第161条及《公证程序规则》第11条，承包人必须亲自到场或通过书面、视频等方式明确表示同意。若承包人未到场且无合法授权，公证机构不得单方出具公证书，否则可能因程序违法导致公证被撤销（依据《公证法》第39条）。

3. 特殊情形：政府依法强制执行或紧急情况
   若政府因公共利益需要（如征收、征用）依法对土地进行公证，且已履行法定程序（如公告、听证、补偿安置等），即使承包人未到场，公证仍可能被认定为有效。但需注意，此类情形需严格符合《土地管理法》《行政强制法》等法律规定，否则承包人可通过行政复议或诉讼主张权利。

建议：

• 若您是承包人，发现公证未获授权或程序违法，可向公证机构提出复查申请（依据《公证法》第39条），或直接向法院提起行政诉讼要求撤销公证；
  
• 若您是政府或相关方，建议提前与承包人沟通，确保其知情并签署授权文件，或通过留置送达、公告等方式履行法定程序，避免纠纷。
  

如有具体案件细节，可进一步向我说明，我将结合证据材料为您分析公证效力及维权路径。