农村自建房强拆是否合法，需分情况讨论：

1. 合法强拆的情形：

   • 程序合法：若农村自建房属于违法建筑，且相关部门已依法履行了调查、认定、告知、催告、作出强制执行决定等法定程序，那么强拆行为是合法的。根据《中华人民共和国行政强制法》的相关规定，行政机关在实施强制拆除前，必须确保程序正当，保障当事人的合法权益。
   • 依据充分：强拆行为必须有明确的法律依据，如《城乡规划法》第六十五条规定，在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。若自建房违反了此类规定，且相关部门已依法作出处理决定，那么强拆行为在依据上是充分的。

2. 非法强拆的情形：

   • 无合法依据：若强拆行为没有明确的法律依据，或者依据的法律条款已被废止或修改，那么强拆行为是非法的。例如，若以已废止的《城市房屋拆迁管理条例》为依据对农村自建房进行强拆，显然是不合法的。
   • 程序违法：即使自建房属于违法建筑，但相关部门在强拆过程中未依法履行法定程序，如未告知当事人有权陈述和申辩、未听取当事人的意见、未作出强制执行决定等，那么强拆行为也是非法的。根据《行政强制法》的规定，程序违法是导致行政行为无效的重要情形之一。
   • 超越职权：若实施强拆的主体不具备相应的职权，如非行政机关或非法律、法规授权的组织实施了强拆行为，那么该强拆行为也是非法的。根据《行政处罚法》的规定，行政处罚由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内实施，非行政机关或非法律、法规授权的组织不得实施行政处罚，同理也不得实施强拆行为。

法律建议：

• 对于自建房主人：若面临强拆风险，应首先确认自建房是否合法，并了解相关部门的处理决定和依据。若认为强拆行为非法，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
• 对于相关部门：在实施强拆行为前，必须确保程序合法、依据充分，并尊重当事人的合法权益。若因强拆行为引发纠纷或诉讼，应积极应对，提供充分的证据和法律依据来支持自己的行为。

可能后果：

• 非法强拆的后果：若强拆行为被认定为非法，相关部门可能面临行政赔偿、行政处分等法律责任。同时，非法强拆行为还可能损害政府的公信力和形象，引发社会不稳定因素。
• 合法强拆的后果：若强拆行为合法且程序正当，那么自建房主人应接受处理决定，并配合强拆工作的进行。若拒不配合，可能面临更严重的法律后果，如被强制执行、承担额外的费用等。

总结：农村自建房强拆是否合法，需根据具体情况进行判断。若您面临此类问题，建议直接向我咨询，以便更准确地了解您的权益和应对策略。