结论：轻伤案件中，双方和解后是否会有案底，取决于案件的具体处理阶段和性质。若案件已进入司法程序，和解后仍可能留下案底；若案件未进入司法程序，通过调解等方式解决，则可能不会留下案底。
分析说明：
案件已进入司法程序：
- 刑事和解与案底：在刑事案件中，即使双方达成和解，如果案件已经进入司法程序，如公安机关已经立案侦查，检察院已经提起公诉，那么犯罪嫌疑人或被告人仍可能面临刑事处罚。在这种情况下，即使和解，也可能留下案底，即犯罪记录。这是因为刑事和解主要影响的是量刑，而非定罪，定罪后就会留下案底。
- 案底的影响：案底，即犯罪记录，会对个人的社会生活产生一定影响，如影响就业、升学、出国等。因此，即使和解，也应认真对待刑事案件，避免留下不良记录。
案件未进入司法程序：
- 调解与和解：如果轻伤案件未进入司法程序，而是通过调解、协商等方式解决，双方达成和解协议，并履行了协议内容，那么这种情况下通常不会留下案底。因为案件没有经过司法机关的正式处理，没有形成犯罪记录。
- 注意事项：虽然未进入司法程序的案件和解后可能不会留下案底，但双方仍应确保和解协议的合法性和有效性，避免后续产生纠纷。同时，对于和解协议的内容，应明确、具体，并尽可能通过书面形式固定下来，以便在需要时提供证据。
特殊场景：
- 自诉案件：在部分轻伤案件中，如果被害人选择向法院提起自诉，而不是通过公安机关立案侦查，那么案件的处理方式可能会有所不同。在这种情况下，如果双方达成和解，被害人可以撤回自诉，案件可能不会进入审判阶段，从而避免留下案底。但这也取决于具体的案件情况和法院的裁定。
行动建议：
- 了解案件性质：首先，应了解案件是否已经进入司法程序，以及案件的性质（如是否为刑事案件）。这有助于判断和解后是否可能留下案底。
- 咨询专业律师：在处理轻伤案件时，建议咨询专业律师，了解具体的法律程序和可能的结果。律师可以根据案件的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助。
- 谨慎处理和解协议：如果双方决定和解，应谨慎处理和解协议的内容。确保协议内容合法、有效，并尽可能通过书面形式固定下来。同时，应履行协议内容，避免后续产生纠纷。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十八条：下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解：（一）因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的；（二）除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的，不适用本章规定的程序。该条款说明了刑事和解的适用范围，但并未直接说明和解后是否会留下案底。案底的形成主要取决于案件是否经过司法机关的正式处理并形成犯罪记录。