在交通事故中，若对方被认定为主责，伤残鉴定费用的承担问题需根据具体情况来分析，以下是详细解答：
保险公司承担的情况：
- 如果事故车辆投保了交强险或商业三者险，并且保险合同中没有明确排除鉴定费用，那么伤残鉴定费用通常被视为查明和确定保险事故性质、原因及损失程度的必要、合理费用。依据《中华人民共和国保险法》第六十四条，这部分费用应由保险公司承担。
侵权人（主责方）承担的情况：
- 如果保险合同中明确约定了鉴定费用不在赔偿范围内，或者肇事车辆未投保，亦或是事故损失超出了保险限额，那么超出部分及鉴定费用应由侵权人，即交通事故中的主责方来承担。
- 在诉讼过程中，如果法院指定了鉴定机构进行伤残鉴定，鉴定费用一般由申请人先行垫付。待鉴定结果出来后，法院会根据案件的具体情况，包括责任比例等因素，判决鉴定费用的最终承担者。若主责方被认定对事故负有较大过错，法院可能会判决其承担相应的鉴定费用。
按责任比例分担的情况：
- 在某些情况下，伤残鉴定费用可能先由申请鉴定的一方垫付。后续在通过诉讼或协商解决赔偿问题时，会根据事故责任划分比例，各方按比例分担费用。例如，如果主责方承担70%的责任，那么其可能需要承担70%的鉴定费用。
自行委托与诉讼过程中的特殊情况：
- 如果伤者在起诉前自行委托有资质的机构进行伤残鉴定，并支付了鉴定费用，那么在后续的诉讼中，除非对方对鉴定结论提出异议并成功申请重新鉴定，否则该鉴定费用一般会被视为伤者的合理损失，由责任方按照责任比例承担。
- 如果一方对初次鉴定结论不服，并成功申请重新鉴定，那么重新鉴定的费用一般由申请人承担。但如果重新鉴定的结论改变了初次鉴定的结论，且对原鉴定结论持有异议的一方因此减少了赔偿义务或增加了获得赔偿的权利，那么法院可能会考虑让原鉴定结论的持有方承担部分或全部重新鉴定费用。
双方协商一致的情况：
- 受害人与机动车方或保险公司就赔偿事宜达成一致意见时，可以共同委托第三方鉴定机构进行伤残鉴定。此时，鉴定费用由双方协商确定承担方式，可能由主责方全部承担，也可能按责任比例分担。
总结与建议：
交通事故中的伤残鉴定费用承担问题复杂多变，需综合考虑保险合同约定、事故责任划分、诉讼程序及当事人协商情况等多种因素。在处理此类问题时，建议你首先查阅保险合同条款，明确保险责任范围；其次，根据事故责任划分情况，合理确定费用承担主体；若遇到复杂情况或争议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更具体的法律建议和帮助，确保你的权益得到妥善维护。