您好，关于事业单位工龄的认定问题，这是一个涉及到您个人权益的重要事项，我会为您详细解答。
首先，我们需要明确什么是连续工龄。连续工龄是指职工在全民、集体所有制企业或国家机关、事业单位连续从事符合工龄计算规定工作的时间。对于事业单位的工作人员来说，连续工龄的计算对于退休待遇、职称评定等方面都有着重要的影响。
接下来，针对您提到的具体情况，即曾在互助职业技术学校上班并签订了劳动合同，学校也为您缴纳了养老保险，但入编认定时发现养老保险显示的是灵活就业，导致人事局不允许认定工龄的问题，这通常与养老保险的缴纳方式有关。根据相关规定，机关事业单位编外聘用人员由单位为其缴纳养老保险的年限可计算为工龄，而个人以灵活就业人员身份缴纳养老保险的年限则不能计算为工龄。
针对您的情况，您可以采取以下措施进行补救：
与原单位沟通：首先，您可以与原聘用单位（互助职业技术学校）进行沟通，要求他们与社保部门联系，将您以灵活就业人员身份缴纳的养老保险费进行退费处理，并按照成建制单位的方式重新核定缴费。这样，您的养老保险缴纳记录就会更正为以单位名义缴纳，从而符合工龄认定的条件。
准备相关材料：在申请工龄认定时，您需要准备一些必要的材料，包括申请书、有关组织或单位录用聘用的相关文件、机关或企事业单位聘用的劳动合同（必须有劳动部门的合同签证方有效）、进入机关企事业单位领取的第一个月及离开单位最后一个月的工资花名册（必须是本人签名的花名册）等。这些材料将作为您申请工龄认定的依据。
按照程序申请：您需要按照机关、事业单位的工龄认定程序进行申请。通常，这需要您填写《机关、事业单位工作人员工龄计算认定审批表》，并携带上述准备好的材料，按干部管理权限进行审批。
关注政策变化：由于政策可能会随着时间的推移而发生变化，因此您在申请工龄认定时，还需要关注当地人力资源和社会保障部门发布的最新政策文件，以确保您的申请符合最新的规定。
最后，我想强调的是，工龄认定是一个严肃而复杂的过程，需要您耐心、细致地准备相关材料，并按照规定的程序进行申请。如果您在申请过程中遇到任何困难或疑问，都可以随时向当地的人力资源和社会保障部门咨询或寻求帮助。希望这些信息能够对您有所帮助，祝您申请顺利！