国有企业子公司与母公司借款转投资款的行为，在符合法律法规和公司章程规定的前提下，是合法的。以下从多个角度对此问题进行分析：

一、法律合规性角度

1. 公司法规定：

   • 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司之间可以相互投资，但需遵守公司章程的规定，并确保不违反法律、行政法规的强制性规定。
   • 子公司作为独立法人，有权根据自身经营需要和母公司的安排，进行资金运作，包括将借款转为投资款。

2. 资金运作合法性：

   • 借款转投资款的行为，本质上是一种资金运作方式。只要这种运作不违反国家金融管理法规，不损害国家、集体和第三人的利益，就是合法的。
   • 国有企业及其子公司作为市场主体，在遵守法律法规的前提下，有权自主决定资金的使用方式。

二、公司章程与内部决策角度

1. 公司章程规定：

   • 子公司和母公司均应制定并遵守公司章程。公司章程中可能对投资、借款等资金运作行为有具体规定。
   • 在进行借款转投资款的行为前，应仔细审查公司章程，确保该行为符合章程规定。

2. 内部决策程序：

   • 子公司作为独立法人，其重大决策（如投资、借款等）通常需要经过董事会或股东会的审议和批准。
   • 在进行借款转投资款的行为前，应按照公司章程和内部决策程序，履行相应的审议和批准手续。

三、实际操作与风险防范角度

1. 合同签订与履行：

   • 借款转投资款的行为应通过签订书面合同来明确双方的权利和义务。
   • 合同中应详细约定借款金额、利率、还款期限、投资方式、投资回报等关键条款。
   • 双方应严格按照合同约定履行义务，确保资金的安全和合规使用。

2. 风险防范措施：

   • 在进行借款转投资款的行为前，应对母公司的财务状况、信用状况等进行充分调查和评估。
   • 子公司应建立完善的资金管理制度和风险控制机制，确保资金的安全和有效使用。
   • 如发现母公司存在财务问题或信用风险，应及时采取措施防范风险。

四、特殊情形与注意事项

1. 国有资产监管：

   • 国有企业及其子公司的资金运作可能受到国有资产监管机构的监督和管理。
   • 在进行借款转投资款的行为前，应咨询并遵守国有资产监管机构的相关规定和要求。

2. 税务处理：

   • 借款转投资款的行为可能涉及税务问题，如利息收入的税务处理、投资收益的税务处理等。
   • 双方应咨询专业税务机构或税务人员，确保税务处理的合规性和准确性。

总结与建议：

国有企业子公司与母公司借款转投资款的行为，在符合法律法规和公司章程规定的前提下，是合法的。但为了确保行为的合规性和安全性，建议双方在签订合同前充分调查和评估对方的财务状况和信用状况，并严格按照公司章程和内部决策程序履行审议和批准手续。同时，双方应咨询专业税务机构或税务人员，确保税务处理的合规性和准确性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。