新入股东定向投资三方公司，在符合法律法规和公司章程规定的情况下，是合法的。以下从多个角度进行详细分析：

一、合法性基础

1. 公司法规定：

   • 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司可以通过增资扩股、股权转让等方式引入新股东。定向投资，即特定投资者对公司进行投资，通常涉及增资扩股或股权转让，只要符合公司法及公司章程的规定，就是合法的。

2. 合同自由原则：

   • 在民事法律关系中，合同自由原则是一项基本原则。新入股东与三方公司之间可以通过签订投资协议等合同文件，明确双方的权利和义务，只要合同内容不违反法律法规的强制性规定，就是有效的。

二、合法性条件

1. 遵守公司章程：

   • 公司章程是公司的“宪法”，对公司、股东、董事、监事、高级管理人员等具有约束力。新入股东定向投资三方公司，必须遵守公司章程中关于股东资格、出资方式、出资比例、股权转让等规定。

2. 履行法定程序：

   • 如果是增资扩股，需要召开股东会或股东大会，形成增资扩股的决议，并修改公司章程。同时，还需要办理工商变更登记手续。
   • 如果是股权转让，需要签订股权转让协议，并办理工商变更登记手续。在股权转让过程中，还需要注意其他股东的优先购买权等问题。

3. 不违反法律法规的强制性规定：

   • 新入股东定向投资三方公司，不得违反法律法规的强制性规定，如不得以非法目的进行投资、不得损害国家利益和社会公共利益等。

三、可能存在的法律风险及防范

1. 合同风险：

   • 投资协议等合同文件可能存在条款不明确、权利义务不对等、违约责任不清晰等问题。因此，在签订合同前，应仔细审查合同条款，确保合同内容合法、有效、明确。

2. 股权纠纷风险：

   • 在股权转让过程中，可能存在其他股东主张优先购买权、股权转让价格争议等问题。因此，在股权转让前，应充分了解公司股权结构、其他股东的意见和态度，并协商确定合理的股权转让价格。

3. 税务风险：

   • 定向投资可能涉及税务问题，如增值税、所得税等。因此，在投资前，应咨询专业税务机构或律师，了解相关税务政策，确保合法合规纳税。

四、建议

1. 咨询专业律师：

   • 在进行定向投资前，建议咨询专业律师，了解相关法律法规和政策，确保投资行为的合法性和合规性。虽然这里我作为陈晓辉律师已经给出了一些基本建议，但具体案件仍需具体分析。

2. 完善合同文件：

   • 签订详细的投资协议等合同文件，明确双方的权利和义务、违约责任等内容，以降低合同风险。

3. 履行法定程序：

   • 按照法律法规和公司章程的规定，履行增资扩股或股权转让的法定程序，确保投资行为的合法性和有效性。

如果您在定向投资三方公司过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。